貝粉
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2021年12月13日(月)
Koichi Kawakami, 川上浩 @koichi_kawakami
抗原定量検査やるくらいだったら、LAMP法をもっと普及させるべきですよね。
感度は、RT-qPCR＞LAMP＞抗原定量の順で、RT-qPCRは1000倍、LAMPは数倍程度、抗原定量検査より感度が良くて、LAMP法ははるかに簡便で安価です。 twitter.com/koichi_kawakam...
タグ：
posted at 23:26:02
んー，私は官僚ではなくて，厚労大臣＝自民党側だと思っています。自民党がPCRにするよと言ったときに，官僚サイドが抵抗できる上清ではないと思うのです。 twitter.com/koichi_kawakam...
タグ：
posted at 23:11:50
Koichi Kawakami, 川上浩 @koichi_kawakami
#報道ステーション も抗原定量検査推しだったようですね。”厚労省がPCR検査と同等と言ってる"と。
ある局面では、抗原定量検査を用いても良いですよ。"同等"という虚偽は許せません。抗原定量は感度にしてPCRの1/1000です。なぜ厚労省あげてセールスしてるのでしょう？
#空港検疫をPCRに戻して下さい
posted at 23:10:14
Koichi Kawakami, 川上浩 @koichi_kawakami
＞厚労省「抗原定量についてはPCRと高い一致率を示すという調査研究も」
ありがとうございます。このデータ、"行”が同じ検体でしょうか？厚労省、最初、抗原定量はLAMP法と同程度と言っていたのですよね。これを見ると、LAMPに劣るし、RT-qPCRにはるかに劣りますね。
#空港検疫をPCRに戻して下さい twitter.com/SQ300/status/1...
タグ： 空港検疫をPCRに戻して下さい
posted at 23:05:52
@nr6IQGSswVgxqqz @koichi_kawakami 抗原定量についての
厚労省の見解はこちら↓
2020年7月の厚労省部会資料の4ページ目にある、
www.mhlw.go.jp/content/109060...
鼻咽頭・唾液PCR、唾液抗原定量の比較表(添付画像)の下1/3のデータや、
(2/ pic.twitter.com/SnEjh7ZeP7
タグ： 言質
posted at 22:58:24
@nr6IQGSswVgxqqz @koichi_kawakami 後藤厚労相の
「PCRと抗原定量に殆ど差がない」には驚いたが、12/3の厚労相記者会見の最後でも、
www.mhlw.go.jp/stf/kaiken/dai...
「抗原定量検査については、PCR検査と高い一致率を示すという調査研究もあります。また、PCR検査よりも処理能力も高い」
と述べているので、これが厚労省の認識なのだろう。
(1/
タグ： 言質
posted at 22:57:53
長妻議員「オミクロン株に対応するため、年末年始の人の流れを抑制するのか、それともこのままでいくのか？」
岸田総理「水際対策を講じ、マスク、手洗い、三密回避をしっかり呼びかける」
長「人流を絞るのか聞いてる」
岸「無料検査も開始し、三密回避をしっかり政府としても発信していきたい」 pic.twitter.com/lOk34LKv5N
タグ： 言質
posted at 20:21:00
日本はコロナ禍で2年経つのに、最初の入り口の空港検疫で高精度のPCR検査をしない言い訳として、「コンテナくらい大きい」とか言っていた。
一方で中国は、1年以上前にPCR検査機器を満載した検査バスを各地で量産して現場に投入し、残り火を消すために使って成功した。
#空港検疫をPCRに戻して下さい twitter.com/sunasaji/statu...
タグ： 空港検疫をPCRに戻して下さい
posted at 18:34:33
Koichi Kawakami, 川上浩 @koichi_kawakami
後藤厚労大臣にここまで恥をかかせても、空港検疫で抗原定量検査を守りたい勢力って、なんなのでしょうね？
#空港検疫をPCRに戻して下さい
タグ： 空港検疫をPCRに戻して下さい
posted at 17:15:52
Koichi Kawakami, 川上浩 @koichi_kawakami
＞抗原検査とPCR検査は性能に殆ど変わりがない
この前、岡部さんがPCR検査の方が性能が良いことを認めたのに、またここに戻っちゃったんですか？
デマです。厚労大臣がなぜデマを国会で言うのでしょうね？
議事録に残りますね。責任は必ずとってもらいましょう。
#空港検疫をPCRに戻して下さい twitter.com/nr6iqgsswvgxqq...
タグ： 空港検疫をPCRに戻して下さい
posted at 16:56:43
Koichi Kawakami, 川上浩 @koichi_kawakami
nagayaさん（@nagaya2013）が引用したnetureダイジェストの図（→www.natureasia.com/ja-jp/ndigest/...）
とてもよくできていますが。迅速抗原検査が過大評価なのを訂正して、抗原定量検査も書き込んで補足します。こういうことです。 twitter.com/nagaya2013/sta... pic.twitter.com/svd1t9zxt2
タグ：
posted at 14:16:24
Koichi Kawakami, 川上浩 @koichi_kawakami
＞ルミパルスでもオミクロンを検出できて
ルミパルスでオミクロンを検出しているわけじゃないですね。オミクロン株と従来株をあわせて、SARS-CoV-2として検出できているということですね。その感度はPCRに劣るため見逃しがでます。
rgbさんがわかっているのはわかっていますが、念のため。 twitter.com/C45425/status/...
タグ：
posted at 12:47:13
Takuro⚓️コロナ情報in神奈川県/ @triangle24
12/13月 北海道の感染拡大 GoToが主因か 近畿と首都圏からウイルス流入
ゲノム解析するとよくわかる。少なくとも8回道外から流入し、置き換わり
最多は9月末から近畿圏から流入と推定されるウイルス。そして、10月以降は首都圏から相次ぎ計8回中5回が首都圏から入ったと推測
www.asahi.com/articles/ASPD9...
タグ：
posted at 12:21:41
『ICO』storyboard
#ICO20thANNIVERSARY pic.twitter.com/6Utobk5XEt
posted at 12:01:00
Koichi Kawakami, 川上浩 @koichi_kawakami
@C45425 ありがとうございます。😊
新しい変異株の出現で感度がおちている可能性があるのは、抗原検査の方ですよね。
タグ：
posted at 10:15:45
Koichi Kawakami, 川上浩 @koichi_kawakami
PCR検査（RT-qPCR検査）はプライマーと蛍光プローブを改変、追加することによって、従来株、オミクロン株を同時に検出、判定することも可能で、そのようなシステムのセットアップは”容易に”できます。（以前tweetしましたが、生物系大学院生レベル)
#モーニングショー
#空港検疫をPCRに戻して下さい twitter.com/koichi_kawakam...
posted at 10:14:03
非公開
タグ：
posted at xx:xx:xx
非公開
タグ：
posted at xx:xx:xx
Koichi Kawakami, 川上浩 @koichi_kawakami
PCR検査キットは通常N遺伝子のどこをターゲットにしているかプライマーの配列を公開しています。新しい変異株に対応できるかは一目瞭然。富士レビオルミパルス抗原定量検査法、抗原検査のためには抗体が必要ですが、その抗体がN蛋白質のどこをターゲットにしているのかを開示していません。
@C45425 twitter.com/koichi_kawakam...
タグ：
posted at 09:59:56
Koichi Kawakami, 川上浩 @koichi_kawakami
森内氏の嘘：抗原定量検査、PCR検査のターゲットは通常N蛋白質、N遺伝子。共にNに変異が入れば感度に影響が出る可能性がある。PCRはN遺伝子の配列から即座にそれを判断できる。抗原検査は実際に活性検定が必要だし感度が下がっていた場合に対応できない。抗原検査の有利な点は無い。
#モーニングショー twitter.com/sunasaji/statu...
タグ： モーニングショー
posted at 09:46:56
だから結論は変わらなくて、抗原定量検査はPCRに比べればかなり沢山の偽陽性を出すし、PCRでなら見つかったはずのウイルス量の少ない人のかなりの部分を見逃すということ。
そもそも偽陽性も偽陰性もPCRの陰性と陽性を元に評価される。
PCRより抗原検査の方が感度や特異度が良いと発言した時点で誤り。
タグ：
posted at 09:34:28
#モーニングショー で森内氏が、抗原定量検査よりPCRの方が陰性出るとか言ってたらしいが、ある意味正しい。
なぜならルミパルスは特異度が72.7%とか低過ぎて、膨大な偽陽性が出るから。
感度は98%で高いじゃん、と思うかもしれないが、Ct33以下でウイルス量が多い場合の話。
www.sciencedirect.com/science/articl... pic.twitter.com/qdDXXroUBE
タグ： モーニングショー
posted at 09:29:18
Cheeman M.D.,Ph.D. @kakeashi_ashika
岐阜県保健環境研究所の広報から。
NGSはiSeq100を導入している。合理的に物事を考えることのできる、極めて優秀な方がおられると思う。
www.health.rd.pref.gifu.lg.jp/kankoubutu/tay... pic.twitter.com/9hexTZhwdl
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posted at 01:13:16
Cheeman M.D.,Ph.D. @kakeashi_ashika
空港検疫では捕捉できず、岐阜県で診断に至った例。
地方自治体で唯一、1億円かけてロシュのコバス8800を導入したことが実を結んだと言える。この全自動PCR機は高速大量処理ができるだけでなく、検出能力において他の追随を許さない圧倒的世界一である。
www.gifu-np.co.jp/news/20211211/...
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posted at 01:05:09
2021年12月12日(日)
#十二国記の日
#十二国記の日2021
記念日絵っぽくないけど陽子の殺陣が見たい欲に逆らえなかった
十二国記の日おめでとうございます！ pic.twitter.com/n9jPhOjLUf
タグ： 十二国記の日 十二国記の日2021
posted at 23:24:10
Koichi Kawakami, 川上浩 @koichi_kawakami
山本氏「完璧が無理な以上必ず入ってきてしまう前提で時間を稼いでいる間に対策を打ったり感染の山を低くする施策をします」
＞感染の山を低くする施策
感染の山を低くするためのコスパの良い施策の一つは水道の元栓を絞る"水際対策"です。
@Ichiro_leadoff
@knife900
#空港検疫をPCRに戻して下さい twitter.com/knife900/statu...
タグ： 空港検疫をPCRに戻して下さい
posted at 20:51:34
Koichi Kawakami, 川上浩 @koichi_kawakami
＞1人の感染者が仮に2人に感染させるとして、20日後には50万人に感染させる計算
日本では、厚労省にも政府にも政治家にも(国民の多くにも?)、この考えが理解されていないように思う。
最初の一人を防ぐこと、感染者を一人でも減らすことが、どれほど大事なことか。
#空港検疫をPCRに戻して下さい twitter.com/ponpon4183/sta...
タグ： 空港検疫をPCRに戻して下さい
posted at 20:35:00
Koichi Kawakami, 川上浩 @koichi_kawakami
＞堀賢(順天堂大)とレニック・ニコラス(NTT東日本関東病院)も言っていた
「水際対策は時間稼ぎにしかすぎない」（ので、空港検疫は適当でいい、感度・精度が悪い抗原検査でもかまわない）というプロパガンダが始まったのですか？
そうだとしたら、とんでもないですね。
#空港検疫をPCRに戻して下さい twitter.com/wankogasuki264...
タグ： 空港検疫をPCRに戻して下さい
posted at 19:46:51
日本全土に広がるのに3週間
検査結果に現れてくるのに2週間
その人たちが入院するのに3週間
医療崩壊するのに1週間
1ヶ月半〜2ヶ月かな。
来年4月頭にο株対応ワクチンが利用可能になるとして、2022年1月末までのあと1ヶ月半、水際対策で時間を稼いでくれないと困る。
タグ：
posted at 18:44:19
...1日当たりのピークですが、それも民間検査会社への委託かも。PCRの80～90％は保険診療による民間検査会社での検査に依存しています。
木下クリニックなど非医療的検査会社がPCR検査を拡大したのは厚労省の想定外でしょう。
静岡県のPCR実施件数
stopcovid19.code4numazu.org
...... pic.twitter.com/WHrewCOrjC
タグ：
posted at 17:53:18
...
2020年4月に急遽コロナPCRが保険収載され、コロナ第１波後の2020年5-6月頃に病原性検体の搬送手順などの詳細が取り決められて医療的な民間検査会社がPCRに協力できるようになり、当院も2020年7月第2波から民間検査会社にPCR検査を依頼しています。保健所行政PCR検査は今年7月29日の785件が......
タグ：
posted at 17:50:45
...含めて1日20件まで、と保健所に言われました。行政PCR検査の貧弱な体制は強化されるどころか、むしろこの10年余、新自由主義による公的部門削減でますます弱体化していたようです。
地方衛生研究所全国協議会 日本記者クラブ会見 2020/8/11
www.youtube.com/watch?v=E77_KH...
...... pic.twitter.com/EZW4aoXcij
タグ：
posted at 17:50:06
...
実際にはこの10年あまり、各都道府県の地衛研のPCR体制はコロナまで全く増強されず、防疫上の法的な位置づけも曖昧なまま、予算不足、人員不足のまま放置。
2020年3月に当院がコロナのPCR行政検査を保健所に依頼した際は、静岡県の地衛研のPCRキャパは、コロナ以外のノロウイルスなどのPCRも......
タグ：
posted at 17:46:22
...
＞とりわけ、地方衛生研究所のＰＣＲを含めた検査体制などについて強化するとともに、地方衛生研究所の法的位置づけについて検討が必要である。
厚労省 新型インフル 総括会議報告書 2010/6/10
www.mhlw.go.jp/bunya/kenkou/k... pic.twitter.com/E603c9d8WW
タグ：
posted at 17:45:28
...
2009新型インフルでも、保健所経由での行政PCR検査のみが想定され、各県の地衛研のPCR検査を強化すべきだと厚労省も言ってます。
＞ 国立感染症研究所、保健所、地方衛生研究所も含めた日常からのサーベイランス体制を強化すべきである。
......
タグ：
posted at 17:44:34
＞どうすれば、よかったのでしょうね？
宿題のお答え。
そもそもパンデミック急性期のPCR検査を、保険診療で行うことは想定されていませんでした。
（2012年に保険収載されたインフルエンザ核酸検査（2012年保険収載時2000点 現在410点）には、パンデミック対策の観点はなし）。
...... twitter.com/koichi_kawakam...
タグ：
posted at 17:43:46
これ要するに
www.cas.go.jp/jp/seisaku/ful...
新型インフルエンザ等対策政府行動計画に書いてあることで、「新型インフルエンザ等が海外で発生した場合、病原体の国内への侵入を防ぐこ
とは不可能であるということを前提として対策を策定することが必要である。」(p.5)と、、、 twitter.com/vogelsang7/sta...
タグ：
posted at 17:32:29
覚え方は、「2×2表作って、左上×右下を右上×左下で割れば終わり」。
最後に1-リスク比するだけ。
みんな気になるο株クラスターニュースがあったら、やって見て。
ワクチン効果は現実世界で本当に+なのか？
ちゃんと実例を見ていかないといけないと思う。
タグ：
posted at 15:46:53
で、ワクチン効果の計算だけどシンプルに①リスク出して、②リスク比みて③%に直すだけなので誰でもできる。
VE=(非接種者リスク-接種者リスク)/非接種者リスク
=1-リスク比
接種 非接種
感染数 A1 A2
母集団 B1 B2
リスク比=(A1/B1)÷(A2/B2)
=(A1*B2)/(A2*B1)
タグ：
posted at 15:46:52
ο株への感染予防効果を検討したらガチで大きなマイナスになったから(δ-マサチューセッツは-26%でしかなかった)。
それはおかしい様に思うし、保健当局は母集団の接種率、事例毎にちゃんと公開して欲しいなと。
タグ：
posted at 15:46:52
保健当局者は「だめだ」とハッキリ言わなければならない。
だから、クラスター発生毎に母集団の接種率を出してのリスクコミュニケーションが、すごく大事だと思う。
打っといて放置はないだろう…と。
これを今日言ったのは、母集団の接種率が分からなかったから現状アメリカ全体の接種率を使って
タグ：
posted at 15:46:52
あるのでは？ということ。
ワクチン効果は「慎ましい生活」、パンデミック下のnew-normalとセットで臨床試験で保証されたのであって、
ワクチンパスポートとかやるなら、それがワクチン効果をぶち壊さないか？はちゃんと議論されるべきだし
もし「ワク接種者ほどパーティーして感染してる」地域なら
タグ：
posted at 15:46:51
当然、「ワクチン接種者ほどイベント行く、参加できるからでは？」と返信あって。もちろん俺も超そう思うんだ(じゃないと繋がらないし)
大事なのは、「うん、だからワクチン効果は(生物学的に)残ってるね」ではなくて、
「うん、だからワクチンは(社会的に)逆効果だね」
と声を大にして言う必要が
タグ：
posted at 15:46:51
僕が「ん？イスラエルの発表から計算するとδ株へのワクチン効果33%(これは後に接種後期間のデータがイスラエルから出され科学的に繋がる)」
「マサチューセッツ市民のδクラスター、マサチューセッツ市民のワクチン接種率からVE出すとマイナスなんだけど…」とTweetすると
タグ：
posted at 15:46:51
#新型コロナウイルス肺炎 上海の14+7の7の7日間健康監測について。
①朝晩1日2回検温。
②不必要な外出避ける、特に人混みに行かない。
③外出時必ずマスク。
④集まる活動ダメ(勿論会食ダメ)。
⑤発熱・咳→発熱外来。
補足:期間中PCR検査は複数回。これは出発したエリアにより回数が増やされます。 twitter.com/steco_shimizu/...
タグ： 新型コロナウイルス肺炎
posted at 15:08:15
吉村知事は、一年前に、関西広域連合から看護師を大阪府に派遣して頂くまでは、関西広域連合委員会をほとんど欠席しておいて…。 twitter.com/ncc170116/stat... pic.twitter.com/S2wD5sCgGW
タグ：
posted at 12:48:50
#100日で収束する新型コロナウイルスリターンズ
100日目 新型コロナの終わり方 pic.twitter.com/p8RPOs7oBo
posted at 12:44:58
前から気になっていたが、吉村知事は他自治体の首長が維新か否かで明らかに態度が違うよね。関西広域連合では欠席王だったのに、他の維新知事が生まれた途端にこれ。井戸前知事にこんな働きかけしたか？ 府内自治体の首長に対してもそう。府知事よりも「党人」として活動している感じが強い。 pic.twitter.com/htHQHZqvmg
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posted at 11:35:29
マジか大阪
大石あきこ「大阪府、何を血迷ったか、11月末で高齢者施設での定期PCR検査を打ち切った。」 twitter.com/MMT20191/statu...
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posted at 10:46:13
西村 カリン (Karyn NISHIM @karyn_nishi
ブロック解除された。良かったです。@konotarogomame pic.twitter.com/mGsRmcQTA3
タグ：
posted at 09:39:59
「戦争を人殺し」と表現するとなぜか炎上する。その根には、戦争指導者たちが「敵艦を沈める」「敵基地攻撃」などと勇ましく美化するからだろう。敵艦、敵機、敵基地にも人間はいてその人にも故郷があり、家族がいる。その人を殺すのが戦争。そして失敗すれば自分も死ぬ。しかし指導者は死なないのだ。 twitter.com/ichiki_817/sta...
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posted at 08:12:26
Koichi Kawakami, 川上浩 @koichi_kawakami
12/11(土) 21:00~ のTwitterデモ”#空港検疫をPCRに戻して下さい"
トレンド入りしました。ありがとうございました。
その間に投稿したtweetをまとめました。
togetter.com/li/1815026
タグ：
posted at 00:35:08
