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黒木玄 Gen Kuroki

@genkuroki

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Favolog ホーム » @genkuroki » 2019年11月03日
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2019年11月03日(日)

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

19年11月3日

#統計 有意水準で45度線に近くてかつ45度線をあまりうわまらない方が良いのですが、5以下のセルがあっても補正無しのχ²検定は結構頑健に見えます。

全周辺度数固定の超幾何分布の乱数でサンプルを生成している場合(右下のプロット)は非現実的なので無視してよい。

期待値が

a 10-a
a 10-a

の場合 pic.twitter.com/fXRVKnclqY

タグ: 統計

posted at 23:59:29

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

19年11月3日

#統計 #Julia言語

nbviewer.jupyter.org/gist/genkuroki...
2×2の分割表の独立性検定

「度数が5以下のセルがあったら、χ²検定ではなく、Fisher検定やYates補正を使え」のように根拠を示さずに解説してあるものが多数見つかるので、度数が5以下のセルがある場合も計算してみた。

期待値が

a 6-a
a 6-a

の場合。 pic.twitter.com/KoSyfQHK4g

タグ: Julia言語 統計

posted at 23:52:51

石井晃(2022年3月鳥取大学退職) @ishiiakira

19年11月3日

ネットにあった方法で、コマンドラインでanacondaの再設定を試みましたがcondaが起動しなくて失敗。でも、そのあともう一度anacondaの再インストールを試みたら上手くいきました。多分、正式な方法で古いanacondaを削除して再インストールすればいいみたいです。

タグ:

posted at 23:44:25

ごまふあざらし(GomahuAzaras @MathSorcerer

19年11月3日

ターミナルからJuliaのファイルに書かなくても display で表示させることできるんだ.
$ julia -e "using Makie; plot([1,2,3]) |> display; sleep(30)"

タグ:

posted at 23:05:18

石井晃(2022年3月鳥取大学退職) @ishiiakira

19年11月3日

軽い気持ちでMac OSをCatlinaにアップしたら、Pythonの開発環境が使えなくなって困ってます。anacondaが使えなくなるみたい。ネットで再設定の方法を調べているけど、上手くいかず、anacondaの再インストールもインストーラーの実行にエラーが出る始末。さて困った。当面は大学のパソコンで計算するか

タグ:

posted at 22:58:09

Yukihiro Matz @yukihiro_matz

19年11月3日

今まで音声入力いろいろ試してみたけど、これが一番制限が少なくて使い物になる。基本がGoogle音声入力だから「まる」で「。」とか、「てん」で「、」とかの変換はできないけど。明日からの原稿執筆が捗りそう。 twitter.com/master2020hitu...

タグ:

posted at 22:26:55

非公開

タグ:

posted at xx:xx:xx

試験管 @hottesttube

19年11月3日

ロウソクから立ちのぼる煙を、マッチの火が食べていく様子。
スローモーションで撮ってみた。 pic.twitter.com/e3KeyW8uXD

タグ:

posted at 21:41:21

吉田弘幸 @y__hiroyuki

19年11月3日

最近少しずつポートフォリオやキャリアパスポートの悪い点を指摘してくれる方が増えてきたので心強い。

タグ:

posted at 21:19:36

大村 卓 Taku Omura @trialanderror50

19年11月3日

小2の息子がテレビのスピーカにiPadをくっつけて直に録音している。周りで弟や妹が騒ぐものだから怒りまくってその声まで録音されてさらに怒るw 令和で目にするとは思わなかったwww pic.twitter.com/lIBAni9XZ6

タグ:

posted at 21:16:39

Massimo @Rainmaker1973

19年11月3日

This is why you avoid dropping water or fire retardant directly on houses or buildings, when possible. Watch the effect of the fire retardant on the truck in this demonstration drop [source and full video: buff.ly/329gzO3] pic.twitter.com/9EOeHiLeyS

タグ:

posted at 20:33:46

産婦人科医@成田市 @syutoken_sanka

19年11月3日

こないだHPVワクチンを打ちに来た子どもの親は医者だった。保険証を見て確認した。
結局、正しい情報に触れている人だけHPVワクチンを定期接種として打ってる。5万円分のお得。
いつまで、こんな偏ったワクチン接種を続けるのか。

タグ:

posted at 18:07:52

dc1394 @dc1394

19年11月3日

物性物理学の専門家が、専門でもない放射線被曝の話をしていて、なおかつ福島第一原発事故で「7年間で28万人:被曝死亡推定」などと発言している時点で、トンデモ認定しました。 twitter.com/jpgkg1136/stat...

タグ:

posted at 17:53:05

RYO @1MaAkE4tbjd24Hs

19年11月3日

めっちゃ面白いじゃん p進数やりたくなってきた

tsujimotter.hatenablog.com/entry/hensels-...

タグ:

posted at 16:52:35

弓月 光 @h_yuzuki

19年11月3日

またエログロ系は(今の場合萌えですが)叩きやすいのです。個人感情で「これ許せん」となると自分が絶対的に正しいと簡単に思えてしまいますし。
そういう手合いがネットで騒いで自分の歪んだ正義感の充足を図っているように思えます。 twitter.com/noranoran/stat...

タグ:

posted at 16:33:39

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

19年11月3日

#統計 私の経験では、検定については、既存の信頼できるパッケージが存在していても、自分でコードを書いてみた方が理解がすすむ。

自分で書いたコードであれば他人のコードと違って変更を施す実験をやり易いです。自分で実装するなら、個人的には、計算速度的な劣化のない #Julia言語 がおすすめ。

タグ: Julia言語 統計

posted at 16:31:22

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

19年11月3日

#統計 私が採用したmid-p Fisherの定義は

nbviewer.jupyter.org/gist/genkuroki...

のIn [10]にあります。境目の確率を半分にしてから足すという最もシンプルなやつです。 pic.twitter.com/2V8qpiAACM

タグ: 統計

posted at 16:27:26

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

19年11月3日

#統計 注意:上で試したmid-p版Fisher検定はR言語の

exact2x2パッケージ
www.rdocumentation.org/packages/exact...

の fisher.exact(a, midp=TRUE) で実装されているものとは異なります。exact2x2版のmid-p Fisherの誤差は非常に大きいままです。補正無しχ²検定がよい。

nbviewer.jupyter.org/gist/genkuroki... pic.twitter.com/VRCCFUeQrX

タグ: 統計

posted at 16:20:56

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

19年11月3日

#統計 一方、Fisher検定を補正無しのχ²検定に近付ける補正だと考えられるmid-p版のFisher検定も試すと誤差は小さくなります。

しかし、ピアソンのχ²統計量の超絶シンプルな計算を超えるものではないです。

補正無しのχ²検定は意外なほど頑健です。

添付画像は各検定ごとにP値がx以下になる確率。 pic.twitter.com/9Mrmtq4J5A

タグ: 統計

posted at 16:14:33

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

19年11月3日

#統計 Yates補正は補正無しのχ²検定をFisher検定に近付ける補正です。Fisher検定は、サンプルの周辺度数が調査ごとに確率的に揺らぐ場合には小サンプルサイズで非常に誤差が大きな検定になります。だからYates補正は誤差を大きくする補正になっています。

Fisher検定は不正確な検定だと教えるべき。

タグ: 統計

posted at 16:10:48

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

19年11月3日

#統計

添付画像1。2×2の分割表を4つのポアソン分布で生成するときにも、χ²統計量は近似的に自由度1のχ²分布に従う。

添付画像2は

nbviewer.jupyter.org/gist/genkuroki...
複数の確率分布でカイ二乗検定とG検定とFisherの正確検定を比較

より。同じ場合のFisher検定の誤差は非常に大きい。45度線に近い方が正確。 pic.twitter.com/aWQFswR1EO

タグ: 統計

posted at 16:06:48

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

19年11月3日

#統計 #Julia言語

nbviewer.jupyter.org/github/genkuro...
r×cの分割表におけるPearsonのχ²統計量
↑ついさっきまた更新した

添付画像

3×4の分割表を12個の独立なポアソン分布で生成したときのχ²統計量の分布は、周辺度数を何も固定していないのに、自由度(3-1)(4-1)=6のχ²分布に近似的に従う。 pic.twitter.com/qhSEqly2mN

タグ: Julia言語 統計

posted at 16:02:34

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

19年11月3日

#統計 続き

* 一般のr×cの分割表で全周辺度数固定抜きに、ピアソンのχ²統計量が近似的に自由度(r-1)(c-1)のχ²分布に従うことは、周辺度数が固定されない分布に従う乱数でサンプルを生成してχ²統計量のヒストグラムをプロットすればすぐに分かります。

タグ: 統計

posted at 15:19:44

非公開

タグ:

posted at xx:xx:xx

あ〜る菊池誠(反緊縮)公式 @kikumaco

19年11月3日

下村を文科大臣にしたのは大失策だったな。オカルトだし twitter.com/redfield_ken/s...

タグ:

posted at 15:02:21

弓月 光 @h_yuzuki

19年11月3日

何度繰り返しても懲りないらしい😔 twitter.com/ZoppyM87/statu...

タグ:

posted at 14:59:00

Hideki Kawahara: WAS @hidekikawahara

19年11月3日

NHK技研のデモで紹介した対話的実時間室内音響計測アプリをWindows用にコンパイルし、MATLAB非依存で以下に置きました。技術資料はGitHub。後はAudio Toolboxに移行後。Mac版は、audiorecorderの問題解決後。黄色の線は、測定誤差。声で妨害のデモ

drive.google.com/open?id=1gebht...

github.com/HidekiKawahara... pic.twitter.com/i38GvzhePE

タグ:

posted at 14:23:12

(「・ω・)「ガオー @bicycle1885

19年11月3日

Julia,Makefile手書きでとても偉い。

タグ:

posted at 13:51:45

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

19年11月3日

#統計 2019年8月24-26日 遺伝統計学・夏の学校@大阪大学でも、分割表のχ²検定の自由度に関する世界的に広まっている誤解を教えていたので、出席者達は注意した方が良い。

* 2×2の分割表のχ²統計量が近似的に自由度1のχ²分布に従うことを示すためには、周辺度数をすべて固定する必要はない。

続く

タグ: 統計

posted at 13:17:23

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

19年11月3日

#統計 添付画像は

www.sg.med.osaka-u.ac.jp/files/StatGenS...

2019年8月24-26日
遺伝統計学・夏の学校@大阪大学 講義実習資料
統計学入門
大阪大学大学院医学系研究科 遺伝統計学

より。この夏の学校の出席者達は、分割表のχ²検定の自由度に関する世界的に広まっている誤解をそのまま教わってしまっている。続く pic.twitter.com/sOpP7kS4TD

タグ: 統計

posted at 13:13:58

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

19年11月3日

#統計 Googleで

(分割表 OR クロス集計表) 独立性 検定 自由度 site:ac.jp -Excel

を検索↓

www.google.com/search?q=%28%E...

大学で分割表について間違った考え方を教えまくっていることを確認できる。かなりひどい。

たぶん、訂正されることもないだろう。最近の具体例に続く。

タグ: 統計

posted at 13:09:46

DHいとうさん @dh_itou3

19年11月3日

#ロボット じゃないけど一番ビックリした奴。細かい砂に空気を混ぜる?と瞬時に液体化する!また空気を止めると固まる!! pic.twitter.com/K6Mp5dlhsM

タグ: ロボット

posted at 13:05:04

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posted at xx:xx:xx

dc1394 @dc1394

19年11月3日

水素原子に対するシュレーディンガー方程式のFEMの、要素マトリックスを計算しました。これからコーディングに入ります。 pic.twitter.com/aX93qisII0

タグ:

posted at 11:51:22

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タグ:

posted at xx:xx:xx

松浦晋也 @ShinyaMatsuura

19年11月3日

軽減税率を導入した時点で、消費税の利点であった「簡素簡明な制度」は失われている。消費税は廃止を。 twitter.com/ShinyaMatsuura...

タグ:

posted at 11:29:50

羽藤 由美 @KITspeakee

19年11月3日

市場化・民営化=利権化

タグ:

posted at 11:18:51

羽藤 由美 @KITspeakee

19年11月3日

何度でも言う。民間試験導入に関わる今回の混乱の責任をとるべきなのは萩生田文科大臣ではなく,下村・元文科大臣。下村氏の責任を追及しなければ,公教育の市場化・民営化は止まらない。
twitter.com/KITspeakee/sta...

タグ:

posted at 11:11:48

羽藤 由美 @KITspeakee

19年11月3日

衆院文科委における城井崇議員らの質疑により制度の欠陥が表面化し大学が民間試験の利用を躊躇した際にも,下村博文氏が質疑に立ち,文科省や各国立大学に間接的な圧力をかけた。
twitter.com/KITspeakee/sta...

タグ:

posted at 11:05:07

Aki Ariga @chezou

19年11月3日

Leakageやgarbage in garbage outの話などを事例ベースで紹介している良いまとめ。なんか既視感あるトピックが多いなと思ったら「仕事ではじめる機械学習」も参照されていてお茶吹きそうになったw/失敗から学ぶ機械学習応用 www.slideshare.net/HiroyukiMasuda...

タグ:

posted at 11:01:47

羽藤 由美 @KITspeakee

19年11月3日

たとえば,東大が2018. 3月以来,民間試験を「使わない」→「使う」→「学内ワーキンググループ」と混乱した際,下村氏が五神総長を自民党本部に呼びつけて圧力をかけたという噂は中央紙の記者なら誰もが知っている。確認して報道すべきだったがしなかった。国会の証人喚問で今から確認してほしい。→

タグ:

posted at 10:58:32

吉田弘幸 @y__hiroyuki

19年11月3日

高大接続も早くやめさせないと高校が受験予備校化してしまう。

タグ:

posted at 10:47:29

羽藤 由美 @KITspeakee

19年11月3日

我々は「維持できる制度ではない」と声を上げ続けたが,完全に無視した挙句に,導入延期に伴う今回の混乱。この間に,何度か2020年導入が危うくなる局面があったが,そのたびに下村氏が出てきて強行の道筋をつけた。→

タグ:

posted at 10:40:00

Chris Redfield Ken @redfield_ken

19年11月3日

「下村博文氏が文科省の大臣に在任した2年10カ月の間に、教育面では2020年度にセンター試験がなくなることが決まり、スポーツ面では東京五輪の招致に成功し、スポーツ庁も設置された。」
この人が2020年の諸悪の根源じゃねぇか
newspicks.com/news/1295889/b...

タグ:

posted at 10:29:58

羽藤 由美 @KITspeakee

19年11月3日

第2次安倍内閣の下,教育再生実行会議が2013.10月に第四次提言を公表。これを受けて2014年末に中教審が答申。この間の文科大臣は下村博文。以来,「民間ありき」の審議を経て,2016年8月末に英語民間試験利用が最終決定。以降は「2020年度ありき」で杜撰かつ場当たり的に新入試制度が構築された。→

タグ:

posted at 10:28:01

歩行者は右側通行 @JikanBae

19年11月3日

Julia上でSymPyを使って解こうとしたら、真面目に計算しだすものだからMacのファンが回ってる。 twitter.com/potenten87/sta... pic.twitter.com/2XJMPr0wAy

タグ:

posted at 10:08:19

名取宏(なとろむ) @NATROM

19年11月3日

@ochagashidouzo ご指摘ありがとうございます。

タグ:

posted at 09:51:52

名取宏(なとろむ) @NATROM

19年11月3日

@Toyokeizai 「後悔されました」でなく「公開されました」です。確認不足のままツイートしたことを公開しています。

タグ:

posted at 09:51:32

名取宏(なとろむ) @NATROM

19年11月3日

@Toyokeizai それにしても、日本酸化療法医学会の渡井健男会長が「美容系に多いが、規定の治療法を守らない医師が適切な説明をせず、内容をわかっていない芸能人が『ステマ』的な投稿をしていることを問題視している」とコメントしていますが、どの口が言ってんのかな?

タグ:

posted at 09:47:26

名取宏(なとろむ) @NATROM

19年11月3日

@Toyokeizai 今回はSNS上の広告の是非にフォーカスした記事です。記者の方は、医学的な内容や歴史についてもたんねんに取材されましたが、血液クレンジングを推進する別の医師は違うことを主張したはずで、専門家でない記者が正誤を判断するのが困難で、効果の真偽を断定しない態度は誠実だと思います。

タグ:

posted at 09:46:59

壱岐津 礼 @ochagashidouzo

19年11月3日

@NATROM 「後悔」されてます。「公開」ですよね?

タグ:

posted at 09:43:47

名取宏(なとろむ) @NATROM

19年11月3日

取材を受けた記事が後悔されました。 血液クレンジング騒動で見えた広告規制の限界 SNSの「医療ステマ投稿」は野放し状態 | 健康 - 東洋経済オンライン toyokeizai.net/articles/-/311... #東洋経済オンライン @Toyokeizaiさんから

タグ: 東洋経済オンライン

posted at 09:39:10

goropikari @goropikari_

19年11月3日

Genie を作っている人の本なのか。なるほど。
github.com/essenciary

タグ:

posted at 09:31:49

goropikari @goropikari_

19年11月3日

今日の Packt の無料本が Julia だった
www.packtpub.com/free-learning

タグ:

posted at 09:19:11

解答略 @kaitou_ryaku

19年11月3日

よっしゃ!!!!自作CPU完成した!!!12時間ぶっ続けで、徹夜でハンダ付けした甲斐があった。一切バグがなく、いきなり感動したので嬉しすぎる

動画はTD4のキラーアプリ「ラーメンタイマー」をオーバークロック(10Hz)で再生したやつ

@dip_factory 素晴らしい商品をありがとうございました!

#TD4 pic.twitter.com/0aGaPtsCR2

タグ: TD4

posted at 09:00:13

きなこ @3h4m1

19年11月3日

息子と娘①が、食パンの耳をカリカリに揚げて砂糖をかけたアレの最後の一本を巡って喧嘩を始め
息子の

「ブス!」

の暴言に対し、母ジャッジが入るより先に

「あたしがブスか可愛いかは私が決める事でしょ!」

という名言が娘①から飛び出したが、肝心の最後の一本はこの隙に娘②が食った。

タグ:

posted at 07:23:57

HAYASHI Tomohiro @SokoranoKumasan

19年11月3日

「勉強しない悪い子は、もっと悪い大人に利用されて食い物にされる」とは良く言われますけど。やれやれというか…。 twitter.com/yakoni753/stat...

タグ:

posted at 06:05:07

GIGAZINE(ギガジン) @gigazine

19年11月3日

遺伝子研究で「才能ありで生まれるよりも金持ちに生まれる方がいい結果を生む」という結果が発表される(2018)
bit.ly/2oFzZMX

タグ:

posted at 05:30:07

〈 Berger | Dillon 〉 @InertialObservr

19年11月3日

f(z)=z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z^z pic.twitter.com/CrGQJ1dwhF

タグ:

posted at 04:27:00

岡ロ基ー @okaguchikii

19年11月3日

NHKの9時のニュースでも、高校生らが口々に「大人は信じられない」。

世耕さんも、こんなコメントしたら、ますます高校生らから信用されなくなるだけだよ(^_^)。「大人は本当に調子がいい・・」
headlines.yahoo.co.jp/hl?a=20191101-... twitter.com/okaguchikii/st...

タグ:

posted at 03:05:17

岡ロ基ー @okaguchikii

19年11月3日

「今回の入試改革は安倍晋三内閣の目玉政策の一つ。政治主導で始まった改革が、萩生田文科相の問題発言を契機に一気に政治的逆風にさらされたのは皮肉としか言いようがない。」
www.nikkei.com/article/DGXMZO...

タグ:

posted at 03:05:06

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

19年11月3日

#統計 Fisher検定での「すべての周辺度数の固定」やχ²検定のYates補正は、以上で紹介したような代物です。

でも、現代のR言語ではデフォルトでYates補正がオンになっているんだよね。これってどういうこと?

www.rdocumentation.org/packages/stats... pic.twitter.com/GKGRWNKTAs

タグ: 統計

posted at 02:47:44

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

19年11月3日

#統計 Yatesさんは「すべての周辺度数の固定」の正当化のために繰り返しFisherさんの名前を出すのですが、私には論理的な議論をしているようには感じられず、とてもひどい議論の仕方をしているように感じられました。

統計学はこのような議論が許される分野であってはいけないとまで思いました。 pic.twitter.com/7bzJdHR7rH

タグ: 統計

posted at 02:38:18

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

19年11月3日

#統計 私は統計学はど素人なので専門家なら知っているべき文献さえよく知りません。

以上で紹介したYatesさんのχ²検定へのひどい誤解は35年前の話なのですが、おそらく既に日本語で紹介している文献があると思います。

知っている人がいたら教えて下さい。

タグ: 統計

posted at 02:30:50

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

19年11月3日

#統計 結論: 2×2の分割表のχ²検定におけるYates補正のYatesさんは、χ²検定に周辺度数の固定は不要であることを理解していなかった。そのことが原因でFisher検定とYates補正が繰り返し批判される理由を理解できなかった。特別な場合を除いて、Fisher検定やYates補正は使わない方が良いだろう。

タグ: 統計

posted at 02:27:45

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

19年11月3日

#統計 案の定、Yatesさんの論文に付けられたコメントの中にその誤解を指摘するものがありました。

Fisher検定が前提にしているすべての周辺度数の固定は近似の一種であり、Fisher検定は決して正確ではありません。

近似の精度が低いので批判が出て来るのは当然なわけです。 pic.twitter.com/HuU5kn8Jbb

タグ: 統計

posted at 02:23:38

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

19年11月3日

#統計 Yatesさんは

* χ²検定は周辺度数をすべて固定されているという条件を課す検定(conditional test)である

と誤解しています。

これは致命的。明瞭に間違っています。私が繰り返し指摘して来たよくある誤解。

添付画像の引用は既出のYates論文(1984)

mathfaculty.fullerton.edu/sbehseta/Yates...

より。 pic.twitter.com/TFUXK5TIzM

タグ: 統計

posted at 02:16:30

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

19年11月3日

#統計 すべての周辺度数を固定するというFisherさんの無茶な前提が原因でP値が酷く大きめの値になることは繰り返し批判されたようです。

1984年にそのような繰り返しの批判に対して、Yates補正のYatesさんが答えています。

mathfaculty.fullerton.edu/sbehseta/Yates...

この内容がまさに上で指摘した誤解そのもの!続く pic.twitter.com/qMh66l51QT

タグ: 統計

posted at 02:08:10

非公開

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posted at xx:xx:xx

RochejacMonmo @RochejacMonmo

19年11月3日

数学の記述式問題を短答式で行うとしても、例えば(あまりに内容的にくだらない)第二回試行調査 問あの場合ですら、公表された正答例とは異なる形の解答が出る可能性は高い。パターンマッチングしかできない採点者が混じると採点は機能しない。 twitter.com/RochejacMonmo/...

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posted at 00:22:42

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