黒木玄 Gen Kuroki
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- 自己紹介 私については https://twilog.org/genkuroki と https://genkuroki.github.io と https://github.com/genkuroki と https://github.com/genkuroki/public を見て下さい。
2022年11月05日(土)
非公開
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posted at xx:xx:xx
ノア・スミス「習近平よ、永遠なれ。中国は一人の凡庸の男によって自縄自縛となってしまった」（2022年10月17日） econ101.jp/xi-jinping-for...
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posted at 21:35:43
Dr. すきとほる | 疫学専門家 @iznaiy_emjawak
R Studioでコードを書く際はセクション機能を忘れず使おう❗️
Rのコーディングがとっても楽になるぞ。
✅折りたたみ機能があるので画面がスッキリ
✅目次機能があるので行きたい箇所に一発で飛べる
✅ショートカット登録で一発呼び出し pic.twitter.com/HagRr0L2k8
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posted at 18:00:01
HAYASHI Tomohiro @SokoranoKumasan
佐々木俊尚さんのお話に全面的に同意します。
名指しも無いし意識してかは判りませんが、メディアの検証に消極的な日本ファクトチェックセンターの姿勢に対する批判にもなっている。流石。
福島第一原発の「処理水の報道」にみられる「新聞の自浄作用」の欠如
#Yahooニュース
news.yahoo.co.jp/articles/9b6f9...
タグ： Yahooニュース
posted at 17:43:39
三年B組一八先生(金八じゃないよ) @uKi2wQXyG7rx3gL
超算数派の行動を見ていて思ったのですが。
彼らの中には、正解が二つあってはいけない、みたいな教義があるんですかね。 twitter.com/LimgTW/status/...
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posted at 17:08:32
分かり易い説明だなぁ。とはいえオラの場合はよく読んで自分で（といいつつプログラムするのやろうけど）計算してちゃんと検討しないと駄目だけど。コレをまとめると実践的な良い教材というか実例というか使用例になりそうだけど... 。#誰ぞ早よ twitter.com/genkuroki/stat...
タグ： 誰ぞ早よ
posted at 15:05:37
#統計 補足
「有意差なし」は「薬に効果がないこと」を意味し__ない__。
「統計的に有意でない」とか「有意差はない」は「差があるかどうかについてはよくわからなかった」ことを意味します。
「よくわからなかった」という印象は標本サイズが足りていない疑いによってさらに強くなります。 twitter.com/genkuroki/stat...
タグ： 統計
posted at 14:32:58
#統計
www.medrxiv.org/content/10.110... を見ると、Phase 3で必要な標本サイズをどのように見積もっていたかが分かります。添付画像の部分です。
最悪1日しか短縮できない可能性があると考えて、さらに中央値の差の信頼区間が0をまたがない確率を80%以上に設定するべきだったと思われます。 pic.twitter.com/td2bQYsb2W
タグ： 統計
posted at 14:05:48
#統計 必要だった標本サイズの大雑把な見積もり方の解説
差の点推定値は約-24時間で、信頼区間は[-78.7, 11.7]です。
点推定値の-24を保ったまま、信頼区間を縮小して0を含まないようにするには幅を√2.2分の1倍する必要がある。
だから標本サイズを少なくとも2.2倍以上にする必要がありそう。続く pic.twitter.com/a6BagKhmh7
タグ： 統計
posted at 13:39:41
私はこの件についてはど素人なのであんまり信用しないで欲しいのですが、私の大雑把な見積もりでは、そもそも「必要な標本サイズに達していなかった」ように見えるのです。
もしも私の考え通りに標本サイズが足りない治験を実施してしまったのであれば、その原因の明確化は非常に重要だと思われます。
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posted at 13:39:38
結果の信頼区間を見ると、そのために必要な標本サイズは実際に行われたPhase 3の標本サイズの倍程度以上だと大雑把に推定されます。
事前のプロトコル設定の段階でこうなるリスクがあることは認識可能だったと思われるのに、どうしてこんなことになったのか？
誰も得しない状況になっている。
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posted at 13:39:37
事前に取得するデータのサイズを決定するときには、
症状消失までの時間が最低でも1日短縮することを示せないとまずい
と考え、
「中央値の差=1日」という仮定の下で中央値の差の信頼区間が0をまたがない確率が十分に高くなるように標本サイズを決めておく
べきだったと思います。
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posted at 13:39:35
@Jimo0404 #統計 論理的に
差の信頼区間が0を含む⇔有意差はない
なので、5症状消失までの時間の中央値については対プラセボで有意差なしという結果が得られたということです。
「有意に短縮」と赤の太字で書いてある部分はミスリーディング。
私はこの事実に気付いたときに驚き、かなり動揺しました。 pic.twitter.com/ixGhSuZ6lC
タグ： 統計
posted at 13:11:04
@Jimo0404 いいえ、Phase 2bのデータを見て効き目がありそうだとふんだ5症状に限定しても、症状消失までの時間の中央値の差の信頼区間が0を含むという結果しか得られなかったということです。
表中のP値<5%は中央値の有意差を意味しない。中央値の有意差は信頼区間で判断されます。
www.shionogi.com/content/dam/sh... pic.twitter.com/tddUIaL1FS
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posted at 12:53:38
以上は「現時点での公開情報を見たときに、どのように考えるべきであるか」という話に過ぎず、新しいことがわかって来たら、そのたびに考え方を変えて行く必要があります。
↑
これ重要
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posted at 12:49:51
ゾコーバに期待している人達にとってこれは非常に残念なことかもしれませんが、急いで承認しても小さな得しか得られなさそうだし、もしも仮に5症状消失までの時間を短縮する効果がほとんど無ければ(現時点ではそういう恐れがかなりある)効かない薬を承認したことになり被害は巨大になります。
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posted at 12:49:50
信頼区間が0を含んでいるので現時点では十分な証拠がないと考えられる「5症状消失までの時間の中央値が8日から7日に短くなる」という主張が仮に正しいとしても、たったそれだけのことで、ワクチンやマスクや自粛が必要なくなることはありえないと思います。
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posted at 12:49:49
www.shionogi.com/content/dam/sh... のp.26を見た後でも
❌ゾコーバが承認されれば、ワクチンやマスクや自粛は必要なくなる
と思える人はどうかしています。
左半分のグラフの横軸は治療を始めてからの日数で、縦軸は5症状消失者の割合です(+は打ち切り)。
中央値の差の95％信頼区間は0をまたいでいます。 pic.twitter.com/ZKz1Paoac7
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posted at 12:49:48
参考情報：10/12に塩野義製薬は
5症状消失までの時間の中央値のプラセボとの差の95%信頼区間が実は0を含んでいた
という事実を新たに公表しています。
www.shionogi.com/content/dam/sh... のp.26→添付画像①
9/28のプレスリリース www.shionogi.com/jp/ja/news/202... の段階で信頼区間は未公開→添付画像② twitter.com/jimo0404/statu... pic.twitter.com/alcnoPTGxs
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posted at 12:12:34
小学校高学年でScrach使いこなしている場合、次にやるプログラミング言語って何がいいんだろう。やはりPythonなのだろうか。個人的にはJuliaを推したいが
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posted at 10:03:58
非公開
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posted at xx:xx:xx
@MIWI83185420 理由をきっちり説明できればこちらも納得しますがね。
私の職業は今更隠す必要も無いのでお話ししますが，一つ上の校種の数学科なんですよ。
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posted at 08:44:31
Kwat Medetgul-Ernar @KwatMDPhD
Does it matter? The answer is 👇 #datascience #programming #coding #julialang pic.twitter.com/3EQmBZhA5X
タグ： coding datascience julialang programming
posted at 05:51:22
Kwat Medetgul-Ernar @KwatMDPhD
@markkitti @juliabloggers @genkuroki Makes sense. I like StaticArrays, but I try to Pkg.add only if I must. Here are some examples of me over using tuples. And thanks @markkitti for this teaching. pic.twitter.com/0qOb1CELYx
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posted at 03:10:30
Mark Kittisopikul ht @markkitti
@KwatMDPhD @juliabloggers @genkuroki It depends on the size of the problem. If it is small and you do not need mutability, then go tuple. If you need a tuple that looks like an array, see
github.com/JuliaArrays/St...
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posted at 03:08:09
