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黒木玄 Gen Kuroki

@genkuroki

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2021年07月25日(日)

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

何を言っているかわからない人が実在しているだけではなく……

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posted at 23:52:43

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

背中を見せた途端に急に元気に立ち上がるところが好き! twitter.com/buitengebieden...

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posted at 23:19:26

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

#統計 学生や大学院生の報告で、伝統的に不適切だとされている場合にカイ二乗検定が使われていたときに(実際には問題ないのに)、指導教員が、論理と証拠ではなく、伝統的な権威に従って「不適切使用である」と評価している場合もかなりあるのではないか?

これ、本当にかけ算順序問題に似ています。

タグ: 統計

posted at 23:08:43

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

#統計 科学的もしくは医学的に有用な報告であっても、伝統的にカイ二乗検定を使ってはいけないとされている場合にカイ二乗検定を使っているせいで、(本当はそれでも問題ないのに伝統の権威の力で)掲載拒否されている場合も結構あるのではないか?

かけ算順序でバツをつけることに非常に似ています。

タグ: 統計

posted at 23:01:33

sekkai @sekkai

21年7月25日

おお!!私が大学2年生当時大腸肛門外科志望だと言ったら「異常性癖者」呼ばわりしてきた週刊新潮の自称注射も打てるジャーナリスト、那須優子先生じゃないですか!!お元気そうで何よりです☺️ twitter.com/mikito_777/sta...

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posted at 22:48:08

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

#統計 既出ですが、以下のリンク先で紹介している文献では、私と本質的に同じような計算をして、似たようなグラフをプロットしています。結論もほぼ同じです。

自分で計算すると、誰でも同じような結論を得ると思います。 twitter.com/genkuroki/stat...

タグ: 統計

posted at 22:46:58

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

#統計 引用できる査読論文があって、有名な教科書も引用できる。さらに同業の「よくわかっている人達」も同じことを言っている。しかし、そのような事柄はどれも真に正しいことの証拠にはならないわけです。

この辺が数学的にややこしい話題の怖いところだと思います。

タグ: 統計

posted at 22:44:01

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

#統計 このように統計学を応用している各分野の信頼できる専門家であっても、自分で確認せずに、伝統的な権威に従って統計学の誤用について解説していたりします。

この事実に気付いたときに私は非常にびっくりしてしまいました。

今後も繰り返し指摘して行きたいと思います。

タグ: 統計

posted at 22:40:18

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

#統計 モデルのパラメータは

drmagician.exblog.jp/22086293/
EARLの医学ノート
χ2乗検定とFisher正確確率検定
2014-06-06

で、カイ二乗検定が【不適切使用】になるとされている分割表

1 5
24 15

に合わせています。

【不適切使用】になるという意見は伝統的な誤りです。自分で計算すればわかる。 pic.twitter.com/NnSJKkXrT4

タグ: 統計

posted at 22:35:25

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

#統計 同じくalpha errorの確率をプロットしてみました。今度はモデルのパラメータをp=0.074に固定して、有意水準αを動かしてプロットしています。

alpha errorの確率はαに近くなって欲しい。やはり、カイ二乗検定よりFisher検定の誤差が大きい。

ソースコード↓ #Julia言語
github.com/genkuroki/publ... pic.twitter.com/AB2aOUX8RQ

タグ: Julia言語 統計

posted at 22:28:17

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

#統計 モデルのパラメータpによらずに、そのalpha errorの確率は有意水準αに近くなって欲しい。(もともと有意水準αはそういう意味でした。)

以下のプロットを見れば分かるように、この場合にはカイ二乗検定よりもFisher検定の誤差が非常に大きいです。 pic.twitter.com/eXGK7Txn4V

タグ: 統計

posted at 22:24:18

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

#統計 添付画像は、2×2の分割表が2つの二項分布の直積で生成されているときに、カイ二乗検定とFisher検定で第1種の過誤(alpha error)が生じる確率です。有意水準αは5%に固定されています。

ソースコード↓ #Julia言語
github.com/genkuroki/publ... pic.twitter.com/BQWJ3SIh6A

タグ: Julia言語 統計

posted at 22:24:16

積分定数 @sekibunnteisuu

21年7月25日

>ペケにはしないけど書き直させる。

そりゃ駄目な指導。 twitter.com/rigiljp/status...

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posted at 18:36:06

JuliaCon 2023 @JuliaConOrg

21年7月25日

Modeling Marine Ecosystems At Multiple Scales Using #JuliaLang
The repository for this workshop can be found at
github.com/JuliaOcean/Mar...

Abstract: pretalx.com/juliacon2021/t...

#SDG #SDG14 #coding #Oceanscience #ocean pic.twitter.com/V4TVaSfyfN

タグ: coding JuliaLang ocean Oceanscience SDG SDG14

posted at 17:45:00

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

#統計 自分は科学的だと思っている人達であっても、理解ではなく権威に従って統計学を使った論文を書いたり、理解ではなく権威に従って統計学の使い方の部分を査読で問題無しとしている場合は結構多いのでは?

そのように疑われる立場で査読論文や有名教科書の権威を利用するのはやめた方がよい。

タグ: 統計

posted at 17:35:56

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

@higomin 超初心者はTJOさんの解説を参考にしちゃダメ😊

コンピュータの使い方に習熟して「数式は追えないけど、私による計算結果を見る限りは、その結果は正しそうだ/間違っているようだ」と判断できるようになれば、不安を解消しやすくなります。

私自身も数式を負えない場合がかなりあります。

タグ:

posted at 17:28:22

Buitengebieden @buitengebieden

21年7月25日

He loves piggy bag rides.. pic.twitter.com/feZ7fSFs0Z

タグ:

posted at 17:26:06

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

#統計 2×2の分割表の独立性検定に関する伝統的な誤解について理解することも、キーになる数学的概念は

 条件付き確率分布

です。条件付き確率分布達全体から条件を動かす荷重平均で元の分布を再構成できるというような自明な事柄を使って考える(計算機をぶんまわす)ことが大事になります。

タグ: 統計

posted at 17:22:53

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

#統計 統計学の応用で(今の場合には2×2の分割表の独立性検定の応用で)伝統的に言われていることを完全に無視して、素直に自分で計算機を回して確認すれば何が真実であるかすぐにわかります。

査読論文や有名な教科書の引用を根拠にするのはこの場合には権威を根拠にする非科学的行為になります。

タグ: 統計

posted at 17:18:03

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

#統計 条件付き確率分布から元の分布に戻るには、条件付き確率分布の荷重平均を取る必要があります。

だから、条件付き確率分布である超幾何分布だけに帰着するのは無理で、荷重平均の操作で何が起こるかをよく見ないとダメなのです。

Fisher検定で荷重平均の操作を行った結果の誤差は大きいです。 pic.twitter.com/4rNppTZdqb

タグ: 統計

posted at 17:15:06

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

#統計 2×2の分割表のモデル達は以下のように条件付き確率分布の階層を構成しています。

ポアソン分布モデル

↓条件付き確率分布

多項分布モデル

↓条件付き確率分布

2つの二項分布モデル

↓条件付き確率分布

超幾何分布モデル

続く pic.twitter.com/t176PhLrk4

タグ: 統計

posted at 17:15:04

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

#統計 カイ二乗検定を超幾何分布を使う正確なFisher検定の近似とみなして、カイ二乗検定の側が劣っているかのような誤解を専門家とみなされる人達が伝統の権威を根拠で堂々と語っている場合があるので要注意です。

具体例

粕谷英一
分割表
2012.3 生態学会大会自由集会

kasuya.ecology1.org/stats/ct201203... pic.twitter.com/ugyaf0kW4f

タグ: 統計

posted at 17:08:59

非公開

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posted at xx:xx:xx

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

#統計 余裕があれば、私も自分自身で確認してみる場合もあるのですが、ど素人なので結構大変です。いつでもできることではない。

別の誰かがやってくれていてかつ自分にはできそうもない精度で色々確認してくれている場合には、いつもめちゃくちゃ感謝しています。

タグ: 統計

posted at 16:45:48

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

#統計 信頼区間に限らず、推定推測予測が区間の形式で示されている場合は多いです。そのときに、その区間の位置や幅がデータだけではなく、モデルにも強く依存していると認識しておかないと非常に危ないです。

モデルを少し変えたときに推定推測予測の区間がどのように変わるかはいつでも要注意! twitter.com/genkuroki/stat...

タグ: 統計

posted at 16:45:46

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

@higomin TJOさんは基本的なことがわかっていないので、TJOさんの解説に影響を受けない方がよいです。

「確率か、割合か?」という問いの立て方自体がひどくミスリーディングで、「モデルと現実の区別が明瞭か否か?」を問題にした方が教育的かつ実用的です。

詳しくは以下のリンク先を参照。 #統計 twitter.com/genkuroki/stat...

タグ: 統計

posted at 16:30:53

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

#統計 Fisher検定のP値を使うと、第1種の過誤の確率のぶれが、上下に分散せずに、下向きのみになります。これがFisher検定の誤差がn=200程度でも結構大きくなってしまう原因なのですが、第1種の過誤の確率を確実にα以下にできます。

具体例をコンピュータで計算すれば誰でも自力で確認可能です。

タグ: 統計

posted at 16:20:24

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

#統計 2×2の分割表におけるピアソンのカイ二乗検定のP値を使うと、条件付き確率分布としての超幾何分布モデル内での第1種の過誤の確率が上下にぶれます。条件付き確率分布から元の分布に戻るときに、上下のぶれが打ち消しあってならされて誤差が小さくなる仕組みになっています。

続く

タグ: 統計

posted at 16:17:26

非公開

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RochejacMonmo @RochejacMonmo

21年7月25日

学問の有用性の話って
・基礎研究が実際に社会の役に立つまでに時間がかかる
という点が強調されがちだけど
・実際に役立っている学問を役に立たないと主観的に誤認している
・その学問分野が教育活動によって役に立つ人たちを輩出している
といった点がむしろ軽視され過ぎている気がする。

タグ:

posted at 15:39:40

からあげ @karaage0703

21年7月25日

技術書向けのTeXテンプレート、このブログで公開しているものが良い感じでした。Overleafでも使える。 > 初めてLaTeXで技術書を書いて売るまでにやったこと - 3DプリンタとITとプリキュアのブログ precure-3dprinter.hatenablog.jp/entry/2018/08/... pic.twitter.com/fxRRIg7rrR

タグ:

posted at 15:18:44

K.B.砂糖 @KB_satou

21年7月25日

いつの間にか vscode 上の julia の juptyer の挙動が満足行くものになってた。(jupyter lab いらないじゃん)

タグ:

posted at 15:12:07

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

私のようなことを言う人物に敵意を持つ人達が出て来るのは当たり前の話でしかない。😝

敵意は人間的に自然な感情(ただし暗黒面に繋がる感情)でしかない。

たとえ敵意を持ってしまったとしても、引用を正確に行う努力を怠らずに、理解を深める方向に行きたいものです。 twitter.com/genkuroki/stat...

タグ:

posted at 15:10:39

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

@f5e2n8 私個人に敵意を持って下さっても構わないですが、私の発言をフェアに扱ってくれてかつ、私が苦労して紹介している事柄(例えばMayoさんのブログの内容)について理解して頂ければうれしいです。

フェアネスと理解が重要。敵意があってもその2つがあれば問題無し。

この辺で私からの返答は途切れます。

タグ:

posted at 15:06:07

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

@f5e2n8 ここまで来れば、あなたがMayoさんの話を理解できるまで私宛にリプライを送らない方が良かったことは明瞭。

過去の経験から、私には、あなたがMayoさんの話を理解できるまで私宛にリプライを送らない方が良いことは明瞭に見えたので、添付画像のように書きました。

敵意云々もどうでもよいです。 pic.twitter.com/6aEv4hGMgC

タグ:

posted at 14:55:23

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

@f5e2n8 あと不適切な引用についても注意した方がよいです。

以下の私の発言には2つの「何も理解していない」がありますが、そこだけを抜き出して「Mayoさんの話を」の部分を略して引用する行為は、私の指摘の意図(スレッドを何も読まずにクソリプを送っていることの示唆)を不明にする行為になっています。 pic.twitter.com/2rhkN01H3w

タグ:

posted at 14:51:22

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

@f5e2n8 【タグ付けが慣れというか癖になってました。】

こういう言い訳はやめた方がよいです、とう指摘については何かコメントはありますか?

誰でもクソリプを送ってしまうことはある。その後最終的に、「うひゃー!これはひどかった!」→一緒にゲラゲラゲラゲラ(笑)となれば理想。そうなっていない。

タグ:

posted at 14:44:45

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

@f5e2n8 【タグ付けが慣れというか癖になってました。】

え?こういう言い訳はやめた方がよいです。

しかし、私の名前のタグへの私の不快さを無視して構わないと私は言っているのでその件はもうどうでもよいです。

しかし、あなたの本名を教えて下さい。お願いします。タグとして使って連ツイします。

タグ:

posted at 14:24:48

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

@f5e2n8 自分の発言を削除しなくても困らないように、自分の発言についてきちんとコメントを残しておくようにした方がよいと思います。

タグ:

posted at 14:17:10

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

@f5e2n8 削除するのはやめて下さい。削除した場合にはスクショを公開します。

タグ:

posted at 14:14:35

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

@f5e2n8 他人の発言を系統的に見るのが面倒になってしまうようなツイッターの不便な仕様のせいで誤解してしまうことがあるのは仕方がないと思います。

しかし、このような謝罪の文脈で謝罪相手の本名をタグにして使ってしまうことは、ツイッターの仕様ではなく、あなた個人の人格の問題だと思いました。

タグ:

posted at 14:13:30

Illusion of Evidence @ueafam

21年7月25日

@genkuroki ごめんなさい。全部削除します。それとも、この一連のやりとりを私が無かったことにしてしまうのはだめですか?

タグ:

posted at 14:09:46

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

@f5e2n8 これもありがとう。

あと、私の名前をタグにしていることを私は不快に思っています。この私の不快さをあなたは無視して構いません。

しかし、私もあなたの本名をタグにして連ツイしたいので、あなたの本名を返答で教えてくれると助かります。返答があれば許可が得られたと判断して連ツイを始めます。 twitter.com/f5e2n8/status/...

タグ:

posted at 14:04:10

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

@f5e2n8 はい、どうもありがとう。

タグ:

posted at 13:58:46

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

@f5e2n8 「質が低い」だとまるで「それなりにまともなことを言っていた」かのようにも聞こえるので、再度恥の上塗りをしていることになります。 twitter.com/f5e2n8/status/...

タグ:

posted at 13:57:31

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

@f5e2n8 以下のリンク先のようなことを言うのも控えた方が賢明だったと思います。恥の上塗りになっています。

早めに一方的に自分の側に非があったことを気持ちよく認めた方がよいです。私の発言をろくに読まずにクソリプを送ってしまったことは、これを見ている人達には明らかだと思います。 twitter.com/f5e2n8/status/...

タグ:

posted at 13:49:12

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

@f5e2n8 #統計 非常に有名な統計学の哲学者であるMayoさんはその辺の問題にも言及してくれていて、私には参考になりました。p-hackingのような行為を正当化できかねない主張をどのような「専門家達」が昔からして来ているかが分かります。 twitter.com/genkuroki/stat...

タグ: 統計

posted at 13:43:57

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

@f5e2n8 #統計

p-hackingの問題については、豊田秀樹さんが書いた『瀕死の統計学を救え! 有意性検定から「仮説が正しい確率」へ』という本の件がひどいことになっているので要注意です。

尤度原理に基くベイズ統計であればp-hackingと同じようなことをしてよいと本の中で主張しています。 twitter.com/genkuroki/stat...

タグ: 統計

posted at 13:39:22

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

@f5e2n8 きちんとスレッドを読めば自分が最低のクソリプを私宛に飛ばしてしまったことを理解できると思います。

誰でもそういうことがあります。

タグ:

posted at 13:33:20

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

@kado_judo0312 #Julia言語 添付画像中のIn[4]のflush(stdout)にも注目!

「displayとprint, showを組み合わせると、後者を先に実行しても後にまとめて表示されるが、どうすればよいのか?」はJupyterでのJuliaの使い方のよくある質問の1つです。

こういう細かい面倒ごとがある。 pic.twitter.com/25A0sV0WeB

タグ: Julia言語

posted at 13:25:57

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

@f5e2n8 Mayoさんの話を見事に何も理解していないです。

今後この件では、自分が何も理解していないことを理解できるまで私宛にリプライを送らないようお願い致します。

タグ:

posted at 13:16:48

非公開

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posted at xx:xx:xx

あんちもん2 @antimon2

21年7月25日

@NatsureNatsure Juliaでそれに対応するのは f(list...) です。
splat演算子と言います。
(半年くらい前にも同じ話をしてた↓)
twitter.com/antimon2/statu...

タグ:

posted at 11:52:57

鰹節猫吉 @sunchanuiguru

21年7月25日

駄目な考え方・駄目な指導法の見本である。
#超算数

sidouhouannai.jimdo.com/2021/07/18/%E5...

タグ: 超算数

posted at 09:38:12

非公開

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posted at xx:xx:xx

Data Elixir @dataelixir

21年7月25日

Testing Julia: Fast as Fortran, Beautiful as Python by Martin D. Maas, Ph.D. datalxr.com/3x19sGP #julialang

タグ: julialang

posted at 03:04:01

Shuhei Kadowaki @kdwkshh

21年7月25日

@genkuroki 遅くまで観ていただいてありがとうございます。個人的にはうまく説明できなかったことが多くて、正直微妙な感情なんですが、楽しんでいただけたなら良かったです!

確かにメガネ似てますねw 僕は『風立ちぬ』の堀越二郎を真似てあのクラシックなフレームをかけてます笑

タグ:

posted at 02:59:13

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

Tim Holyさん、ノリノリで面白すぎ。

タグ:

posted at 02:05:27

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

Revise.jl はマジ神!

タグ:

posted at 02:04:16

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

雑談:sin(整数)を使う実演では、sin(k)/k の整数 k∈ℤ 全体にわたる和がπに条件収束することを知っているとみばえ的に得をできる場合がある。

1 + 2sum(sin(k)/k for k in 1:10^8)

3.1415926695599605

タグ:

posted at 01:48:38

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

zshを使っているのかな。

タグ:

posted at 01:27:54

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

易しい話題になっている。

タグ:

posted at 01:26:35

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

私の環境では 3x faster ではなく、5x faster なのでさらにうれしい。

タグ:

posted at 01:23:51

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

これ、私のメガネです。

Shuhei-sanとメガネが似ていると思いました。 pic.twitter.com/pnH6qMxVkt

タグ:

posted at 01:17:02

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

#統計 今どきコンピュータなしで統計処理をしている人はいないと思う。正しいかどうかは自分でコンピュータで計算して確かめればよい。

難易度がこの程度の話題であれば,偏見抜きに自分で考えて計算しまくって結論を出した後に文献探索すれば十分。

タグ: 統計

posted at 01:06:12

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

#統計 この手の話題で重要なことは、査読論文や有名な教科書に書いてあるという事実をそれが正しいことの証拠として採用__できない__こと!

誰が書いているか、どこに出版されたか、などなどを完全に無視した上で正しいことを言っているかを確認する必要がある。

権威主義は科学の最大の敵。

タグ: 統計

posted at 01:03:06

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

しかも私の環境はWSLでないナマWindows 10 Home.

タグ:

posted at 00:54:31

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

他人が書いた Jupyter notebook がそのままで何の苦労も無しに正常実行できると気分がいいな。 pic.twitter.com/AyTcLF3Fiq

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posted at 00:53:27

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

こんな感じでJupyter notebookを実行できている。 pic.twitter.com/ywEfwBI2Qy

タグ:

posted at 00:26:32

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

JET.jl すごいな。

そこそこ大きなコードを書いて人はJET.jlを使って、バグの有無や計算速度の劣化の有無を確認した方が良さそう。

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posted at 00:21:03

黒木玄 Gen Kuroki @genkuroki

21年7月25日

コーヒーのまなくてもめがさめたと書いたのを間違って消してしまった。

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posted at 00:08:59

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