黒木玄 Gen Kuroki(@genkuroki)/2022年09月02日

#統計同様の誤用の指摘は，ベイズ統計での事後分布や尤度(ベイズ統計での周辺尤度を含む)についてもされるべき。

尤度(周辺尤度)もまたデータの数値と統計モデルの整合性(もしくは適合性)の指標の1つに過ぎず、それを安易に「証拠」と言い換えることは自信過剰の誤用だと指摘されるべきです。

タグ：統計

posted at 23:59:37

#統計 P値については例のASA声明というのがあって、P値はデータの数値と統計モデル(+パラメータ値)の無矛盾性の指標の1つ(整合性、両立性の指標の1つと同じ意味)であり、P値から自信過剰な強い結論を出すのは誤用であることが周知されつつある。

同様の誤用の指摘は～続く

www.biometrics.gr.jp/news/all/ASA.pdf

タグ：統計

posted at 23:59:36

大津秀一 @shuichiotsu

ころころころな @1EbEq3cCnzsfil4

・感染症学会提言
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他薬では病状進行や死亡の抑制有

ゾコーバ審査報告書「12症状合計スコアの変化量についてプラセボ群と比較していずれの本薬群でも統計学的な有意差は認められず本パートの主要目的は達成されなかった」
www.mhlw.go.jp/content/111210...

twitter.com/shuichiotsu/st...

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posted at 23:57:29

他科に責任転嫁する前に、学会として自浄作用があるかが、問われてると思うな

所詮、その程度の学会か、と

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posted at 23:20:01

みどりり @ETAC1xTLdY7IyCS

塩野義の治験に関わった人が、塩野義の薬を強火推し。
日本感染者学会が、医療従事者にフルボッコされている(笑)

とりあえず、一般人の私が思うことは、誤字脱字
最近嫌われている「させていただく」

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posted at 23:02:29

#統計強い結論が欲しければ、なにがしかの「プラスアルファ」が必要になります。

その辺について正直に強調しているかどうかは、ベイズ統計の特に主観ベイズ主義での解釈の宣伝者がまともかを測る良い指標になると思います。

タグ：統計

posted at 23:00:02

#統計ついでに述べておくと、compatibilityとしての謙虚な(自信過剰に陥らない)解釈は、P値以外にも、尤度や事後分布にも適用可能。

尤度はベイズ統計での周辺尤度ももちろん含む。

compatibilityという弱い結論しか出せない解釈なら、真の分布でデータが生成されているという類の仮定は無用です。

タグ：統計

posted at 22:57:12

訂正

❌どれに
⭕️それに

ちょっとしつこいかもしれませんが、若い人はそういうのに従っちゃダメだと思う。

twitter.com/genkuroki/stat...

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posted at 22:52:28

枇杷 @loquat_priest

なんとか学会とやらが出した「提言」にSNSの医師たちからは顕名匿名を問わず総スカン大ブーイングなわけですが、これだけを見ても「医師と学会が結託してワクチンで金儲けの陰謀！」みたいなのがどれだけありえない妄想かがよくわかりますね。

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posted at 22:50:44

#統計 Greenlandさん達が、P値ではそういう弱い結論しか出せないことを強調したいのは、

* データにどのようにどの程度バイアスが入っている可能性があるか

とか

* ～のためには、この統計モデルの使用は妥当か

のような重大な問いに目を向けさせたいからだと思います。

タグ：統計

posted at 22:49:15

#統計 P値のcompatibilityとしての解釈で、データの数値の出所を問わなくても良い理由は、その解釈が、

　AもBもどちらも信用できないかもしれないが、
　AとBの両立性を数値化すると○○である

というような極めて弱いものだからです。

この点は常に強調されるべきです。弱い！

タグ：統計

posted at 22:43:10

窓リーマン @mado_ryman

一方現在議論がなされている国産抗ウイルス薬は、重症化リスクのない軽症者における臨床試験において呼吸器症状の改善が示されています。加えて臨床第二相(2a)試験以降では主要評価項目であるウイルス量の減少が示されています。

おいおい、ちょっと待てよ…。

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posted at 22:41:38

#統計「P値」→「頻度論」→「真の分布を仮定」というような考えの足りない先生達を、教わっている学生や大学院生の側が厳しく批判するようになればよいと思います。

タグ：統計

posted at 22:39:58

#統計個人的な意見ではベイズ統計と無関係に「頻度論」という言葉自体が時代遅れ。

Greenlandさん達が広めているP値や信頼区間に関する考え方を安易に「頻度論」と呼ぶべきではないと思う。

安易な人達は「P値を使っているから頻度論だ」と言い続けるでしょう。どれに若い人達は従うべきではない。

タグ：統計

posted at 22:37:57

#統計疫学が適用されるデータに、ロジスティックモデルの類のモデルがぴったり適用されるなどと考えることは馬鹿げており、まさに「すべてのモデルは間違っている」という状況になっています。

そういう状況に耐えられる統計学の普及にGreenlandさんは頑張っているわけです。

タグ：統計

posted at 22:33:53

#統計 P値のcompatibilityとしての謙虚な自信過剰に陥らずに済む解釈の普及を推進している中心的な人物の一人がGreenlandさんです。

GreenlandさんはModern Epi.の23章に以下のリンク先のようなことも書いてあって面白いです。

twitter.com/genkuroki/stat...

タグ：統計

posted at 22:30:54

#統計 P値のcompatibilityとしての解釈は、非常に弱い結論しか出さない解釈なので、特にデータの数値が「真の分布」で生成されたという仮定も不要になっています。

これがP値の使い方に関する議論の最前線なので、「頻度論vs.ベイズ主義」とか言っている人達のP値に関する無知がよく分かります。

タグ：統計

posted at 22:27:57

#統計 P値のcompatibilityとしての解釈の利点は、データの数値の出所や信頼性もモデルの妥当性もどちらも仮定していない場合の解釈になっていることです。

この解釈には、データがどこまで信用できるかとか、モデルは妥当か、という本質的な疑問に答えることをP値ユーザーに強制する働きがある。

タグ：統計

posted at 22:23:13

#統計 P値

データの数値とモデル+パラメータ値のcompatibility(両立性)の指標の1つ

という解釈は、特に、データの数値が

　どんなものであっても可能

という点を注意しておけば興味をひけるかな？

ひどくバイアスがかかっていてもよいし、所謂「真の分布」で生成されたものでなくてもよい。

タグ：統計

posted at 22:19:46

枇杷 @loquat_priest

会員の学会発表とか論文では開示させるんだから、提言の最初に「この提言はS社との利益相反を有しています」と大々的に書くべき。
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posted at 22:18:57

さのたけと’ @taketo1024_2

Julia で作り直したことで共同研究者に気軽にプログラムを共有できるようになったのはよかった😌

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posted at 22:14:20

Dr. すきとほる | 疫学専門家 @iznaiy_emjawak

@iznaiy_emjawak 疫学的に妥当ではないランダム化比較試験の誤った解釈であるその主張を、学会の理事長が利益相反の開示なしに提言することに、私は大きな絶望を感じました。

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posted at 21:35:24

@shiraishia_md ありがとうございます。
さっそく拝読致しましたが、審議会で述べられた塩野議の主張から特段変わりはない提言だとお見受けしました。

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posted at 21:28:10

Dr. すきとほる | 疫学専門家 @iznaiy_emjawak

@iznaiy_emjawak こちらです。

www.kansensho.or.jp/uploads/files/...

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posted at 21:21:40

@shiraishia_md 拝見したいのですがネットでリンクを拾えず、ご存知でしたらお教え頂けませんでしょうか？

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posted at 21:19:34

FLASH @Flash_news_ua

⚡️ In the video, the head of the IAEA asks the Russians why the projectile sticks out as if it came from the side of the occupied territory.

The Russian answers that when the projectile arrives, it makes a 180° turn. pic.twitter.com/FwRtAAvfra

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posted at 21:16:19

JuliaPackages @JuliaPackages

New package: OpenSSL v1.0.0 announced #JuliaLang

OpenSSL: OpenSSL Julia bindings

Registration: github.com/JuliaRegistrie...
Repository: github.com/JuliaWeb/OpenS...

タグ： JuliaLang

posted at 21:15:50

日本感染症学会と日本化学療法学会の理事長名で出されています。

利益相反の開示はありません。

内容には、科学的な視点で絶望しました。とても残念です。

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posted at 21:07:10

安川康介@米国内科専門医 @kosuke_yasukawa

この提言の科学性を論じる以前の前提として、日本感染症学会と日本化学療法学会の誰がこの提言をまとめたのか、連名で記載し、全員の利益相反の宣言が必要です。

news.yahoo.co.jp/articles/b33f2...

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posted at 21:01:50

塩野義の薬の承認を促す感染症学会と化学療法学会の提言に驚いています。多くの医者は賛同しないでしょう。塩野義の薬は症状改善に関する主要評価項目について有効性は認められませんでいた。また、この提言の中で塩野義の薬が「呼吸器症状の改善が示されています」と
www.kansensho.or.jp/uploads/files/...

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posted at 20:59:08

ODPP @mmmm24500243

www.kansensho.or.jp/uploads/files/...

これは流石にダメでしょ。
シオノギの薬を承認早くしてくれってこと？

まさかの感染症学会と化療学会理事長。

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posted at 20:48:27

tyltyl　 @mytyltyltyl

Ⓜⓐⓙⓘⓓ Ⓚⓗⓐⓣⓣⓐⓚ @MajidRusiya

日本感染症学会・日本化学療法学会「はやくゾコーバを承認しろっ！間に合わなくなってもしらんぞーっ！」
www.kansensho.or.jp/uploads/files/...

これつまり3相試験の結果出るまで待ってたら承認なんか絶対されないって危機感からきてんじゃないの？出るの11月でしょ？2ヶ月くらい別に待っても良くね？ pic.twitter.com/TzxM17siOT

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posted at 20:46:17

I taught numerical methods using the Julia #programming language last semester. Most students had never heard of Julia before. I will teach numerical methods using Julia this semester too.
#julialang

タグ： julialang programming

posted at 20:45:53

もとさん Ω MD @moto_tkm

KEI@邪エナガ@シミュレーションの世界 @KeiKei47585517

日本感染症学会と化療学会の連名で厚労相に出した提言を読みましたが、臨床で効果が認められない可能性が高い薬でも承認しろって正気ですか？
www.kansensho.or.jp/uploads/files/... news.yahoo.co.jp/articles/b33f2...

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posted at 20:45:06

Hideki Kawahara: WAS @hidekikawahara

#今日の積み上げ

Juliaの行列演算

ほぼMATLABと一緒。
配列添え字のカッコが丸カッコじゃなくて角カッコな点。
flipdimは使えなくて、代わりにreverseという関数を使用する点。
以前はflipdimは存在していたようだが。

#駆け出しエンジニアと繋がりたい

 www.simulationroom999.com/blog/julia-mat...

タグ：今日の積み上げ駆け出しエンジニアと繋がりたい

posted at 20:32:29

天むす名古屋 Temmus @temmusu_n

食後の片付けも終わり家人が二階に戻ったので、エアコン、換気扇、サーキュレータなどを止め、リビングとの襖を閉じて再測定。この再生音圧ではランダム成分は暗騒音起因のものだけになり、非線形性に起因する信号依存応答が分離できている。3kHz以上ではウーファー起因の信号依存成分が消えている。 twitter.com/hidekikawahara... pic.twitter.com/lKv48uUarp

タグ：

posted at 20:25:32

#超算数 1951年指導要領が要求した #掛算の順序、1958年のそれでさらに明らかになった意味説、別にGHQがゴリ押しした訳ではないんですよ。

タグ：掛算超算数

posted at 20:24:29

mtmt @mtmtlife

池田さんの記事、Google Booksでも少し読めるので、糸谷ファンで未読の方はぜひ。
books.google.co.jp/books?id=Aq51B...

タグ：

posted at 20:23:06

はね＠産業医 @hane_ohp

感染症学会員ではないが、この文書一読するだけでそのヤバさは分かるし、TL上の先生方が一斉に声を上げている理由も分かる。これを許すと日本の医学は死ぬよ？
www.kansensho.or.jp/uploads/files/...

タグ：

posted at 20:23:03

木部夏生 @natsuki_kibe

ほのあさ@酒のあるところ 61回 @honoasa

髪が雨に弱すぎて雨の日は前髪がさようならするのは知ってたのですが予想以上にひどい...もうちょっと整えるんだった...！とてもひどい前髪ですがせっかく撮ったので写真も載せました😭ボサボサですみません😣

タグ：

posted at 20:20:41

タグ：新型コロナウイルス感染症における喫緊の課題と解決策に関する提言に反対します

いや、医クラ、色々な所であるかもしれんけど、今回の感染症学会と化学療法学会のこの共同声明には反対してくれないかな……
これ、ヤバいですよ。
学術を論ずる学会としてダメだと思います

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#新型コロナウイルス感染症における喫緊の課題と解決策に関する提言に反対します

posted at 20:16:26

木部夏生 @natsuki_kibe

天むす名古屋 Temmus @temmusu_n

ボードゲームカフェ有明亭に #ゲムマ春2022 で製作に携わった天咲碁所桜を置かせて頂きました！お立ち寄りの際は遊んでもらえたら嬉しいです☺️

春は名前だけが会場にお邪魔しましたが #ゲムマ秋2022 では本体も会場にお邪魔する予定です！ボードゲーマーの皆さまどうぞよろしくお願いいたします✨ pic.twitter.com/nRpDP7iINs

タグ：ゲムマ春2022 ゲムマ秋2022

posted at 20:14:52

ハイフローベア @HFNCteddybear

#超算数【GHQには一教科の教育課程を統制する権限も人的リソースもなかった】。これ、算数教育について1951年指導要領を見ていても感じます。ただし、戦後初期は、IFELなどの影響で海外の教育学の知見が集中的に流入した時代であることは事実でしょう。 twitter.com/tera_sawa/stat...

タグ：超算数

posted at 20:07:40

とんでもないのが流れてきたぞ…
主提言のどれにも賛同できないんだけど、これ本当に学会として言っていいの？

www.kansensho.or.jp/uploads/files/...

タグ：

posted at 20:04:50

Raphael Sonabend @RaphaelS101

I believe in co-design for software, so as I build SurvivalAnalysis.jl I want to make sure it is genuinely useful for people who use the pkg for research or other purposes. I've love to hear your thoughts about pkg structure: github.com/RaphaelS1/Surv... #JuliaLang

タグ： JuliaLang

posted at 20:03:00

tenten@ @tenten2r

Social Media Insuran @Pagerecoveryco

差別せず10万円配布してくれた安倍ちゃんを返してほしい…

タグ：

posted at 19:45:53

This is how they used to break stone before machinery 🤤 pic.twitter.com/BxptbJWK9I

タグ：

posted at 19:32:19

sekkai @sekkai

日本化学療法学会がヤバいのは元々だけど、日本感染症学会は COI まみれでもまだ科学的な判断をしてくれると信じていた自分が本当に愚かだった。米国感染症学会の籍だけ残して日本の感染症学会は退会しようかな…、

タグ：

posted at 19:18:45

sekkai @sekkai

岩田健太郎 K Iwata, MD, M @georgebest1969

日本感染症学会、化療学会と連名で厚労相に出した提言が酷すぎる。「症状を改善させなくても抗ウイルス作用を持つ薬を早期承認しろ」って正気なのだろうか。学会がこんな医学を捻じ曲げているようなことを率先してやるなんて本当に信じられないし、心の底から失望しました。 www.kansensho.or.jp/uploads/files/...

タグ：

posted at 19:16:50

岩田健太郎 K Iwata, MD, M @georgebest1969

まず「新しい抗ウイルス薬の臨床試験において、抗ウイルス効果は主要評価項目の一つです」とありますが、間違いです。抗ウイルス薬が目指すのは「患者の治癒」です。ウイルスを「殺す」のは手段であり、目的ではありません。これはEBMの基本のきの字であり、プロがいろはを知らないのは、言語道断です

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posted at 18:57:03

Hideki Kawahara: WAS @hidekikawahara

感染症学会、化学療法学会理事長の名前で厚労大臣に出された「提言」。いくらなんでもひどすぎるので、絶望しています。一般の方や医師会くらいが言うならともかく、専門家集団とみなされる学会がこれでは救いようがありません。

www.kansensho.or.jp/uploads/files/...

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posted at 18:57:02

常用しているiLoud MMを実際の状況（スピーカと聴取点の距離は60cm）で測定した結果は、これ。台所、リビング、仕事部屋の間仕切りを全部開放して使っているので、揚げ物をしている音で暗騒音のレベルが線形時不変応答以外の応答をマスクしてしまっている。この距離でもモニタースピーカーらしい特性。 twitter.com/hidekikawahara... pic.twitter.com/vhUu8Sq6Fx

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posted at 18:28:50

自作のRust製エミュレーターをWebブラウザーで動くようにした｜Hideyuki Tanaka zenn.dev/tanakh/article... #zenn

【さすがにwasmにするとネイティブと比べて多少は遅くなります。ちゃんと計測したわけではないので正確なことは言えませんが、体感的には倍ほど遅い程度でしょうか】

タグ： zenn

posted at 17:40:46

徳川家康 @ieyasu_unko

@6rId0 ちなみに「算数事件」の途中までしか追えませんでしたが、このスクショが参考になるかと思います。

なんか、りほりほは元小学校教諭らしいですよ🤣
ワシゃ、こんなのが担任だったら登校拒否か転校するわ🤣🤣🤣 pic.twitter.com/Az4W7anv1C

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posted at 17:40:07

Raphael Sonabend @RaphaelS101

@MoseGiordano From the documentation it looks like that checks if there's a '@docs' tag associated with a docstring. Which isn't the same as checking if the docstring itself exists? Just tried it with `checkdocs=:all` and still didn't work! github.com/RaphaelS1/Surv...

タグ：

posted at 17:32:02

Raphael Sonabend @RaphaelS101

Just add a new public Gist for a workflow that checks if you've remembered to document all objects in your #JuliaLang package that should be documented!

Very new to Julia so apologies if this already exists! Comments and PRs welcome.

gist.github.com/RaphaelS1/1e1d...

タグ： JuliaLang

posted at 17:07:48

積分定数 @sekibunnteisuu

確かに笑えない twitter.com/MathTanaka2017...

タグ：

posted at 17:06:30

疲れた。休憩。

タグ：

posted at 16:35:00

Shuhei Kadowaki @kdwkshh

虎視眈々とJuliaするのみ。

タグ：

posted at 15:41:33

Massimo @Rainmaker1973

This diligent robot balancing a triple pendulum poses a huge and successful challenge to chaos

[by Tobias Glück, Andreas Eder, Andreas Kugi of Automation and Control Institute, Vienna University of Technology]

[full video: buff.ly/3DvRfWd-]
pic.twitter.com/8CHmF9fVkq

タグ：

posted at 15:30:00

#Julia言語について

個人的に「もっと早く教えてくれよ」と思った文書はこれ
↓
docs.julialang.org/en/v1/manual/p...
Performance Tips

Juliaを使いたい人は計算速度にも期待している多いと思います。そういう場合には最初にこれに目を通して従った方が時間の無駄が防げます。

タグ： Julia言語

posted at 12:49:00

#Julia言語 #統計上で紹介したコードでは正準方程式を数値的に解いていますが、もっとテキトーに単なるランダムウォークを確率的に適切に許可するコードを書いても結構うまく行きます。(効率は下がる。)

MCMCがらみのコードを色々試すと、StanのNUTSはすごいという気持ちになる。

タグ： Julia言語統計

posted at 12:45:41

無職 @OvitaeSophiedux

2秒後くらいにはJuliaがグローバルスタンダードになってるはず…

タグ：

posted at 12:15:56

雨宮純 @caffelover

「東北有志医師の会」なるグループが新型コロナワクチンに反対する動画を仙台市の電光掲示板に投影。
そのツイートに参政党公式アカウントが「いいね」。 pic.twitter.com/f3X1HNfI5o

タグ：

posted at 12:04:38

#Julia言語今なら、

using Parameters: @ unpack

の行を削って、

@ unpack F, dt, nsteps = lf

などの行を

(; F, dt, nsteps) = lf

に書き換える。

Problemの型とsolve函数の組でコードを書くことはJuliaとの相性が非常に良い。本当はさらにAlgorithmも(以下略)

nbviewer.org/github/genkuro... pic.twitter.com/v1VO4m3Kzz

タグ： Julia言語

posted at 08:51:47

#統計しばらく前に書いたHamiltonian Monte Carloのサンプルコード。所謂MCMCはBayes統計に__も__役に立つ、Bayes統計とは別の話題。密度函数の対数の値が定数差の不定性を除いて分かっているときにその標本を生成する方法の1つ。

nbviewer.org/github/genkuro...

続く twitter.com/rental_kotadon... pic.twitter.com/1keQAD9HFt

タグ：統計

posted at 08:51:45

こーた丼 @rental_math

最近英語資料への抵抗がだいぶ減ってきた。慣れって偉大だなぁと twitter.com/genkuroki/stat...

タグ：

posted at 08:31:16

こーた丼 @rental_math

@genkuroki お。ありがとうございます。頑張って読みます。

タグ：

posted at 08:30:50

玉置　昌義 @Dr_Head_TMI

非常勤：人事会計雇いか、物品会計雇いか？？？
40年ほどに導入された事務系職人の雇用形態の変化を思い起こす。 twitter.com/ProfMasuda/sta...

タグ：

posted at 07:00:12

KRSK @koro485

新しい医療保険関係で婚姻証明が必要なのめんどいな、、、領事館での発行には3ヶ月以内の戸籍謄本がいるらしいけど、戸籍謄本の海外からの取得難易度高すぎん？

タグ：

posted at 06:45:38

МИНАТО Күнио @3710920

そういや私が非常勤で務めていたときも交通費をケチってたなこの大学。 twitter.com/ProfMasuda/sta...

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posted at 06:21:03

ボビン @moyasiman

Julia使った昔のプロジェクトを見てたらJuliaのプロの人にフォローされてた

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posted at 04:21:23

@namururu

茶トラはかわいい。 twitter.com/CatWorkers/sta...

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posted at 00:07:06

”科学に耳を傾ける時だろう。”…オーガニックは嗜好品。

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posted at 00:06:38

”オーガニックは小規模の、地元の、特定のライフスタイル市場には居場所があるだろう。世界の食料安全保障は担えない。オーガニック提唱者が世界の食料安全保障や気候変動、そして健康のためにオーガニックを、と主張すればするほどその逆の科学的根拠が出現して自傷行為になっている。”⇒

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posted at 00:06:37

”マクロン大統領がEUにF2F戦略の根本的見直しを求めている。そしてスリランカの破綻に有機農業が拍車をかけたこと。さらに米国での大規模有機詐欺。さらんさらにオーガニック食品のほうが有害なカビ毒や病原性微生物汚染が多く安全上のリスクが高いと科学的根拠が示している。”⇒

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posted at 00:06:37

”オーガニックの売り上げが減ったのは事実でそれは食品価格のインフレを反映したものである。しかし食品小売業者が懸念しているのには他の要因もある。オーガニックブランドの信頼が低下している

ウクライナ危機で食料安全保障が問題になり、収量の少ない有機栽培への疑問が大きくなったこと。”⇒

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posted at 00:06:36

”食品小売業者は本当にオーガニックの未来を疑問視しているのか？それはどうして？生活コスト危機が、価格の高いオーガニック製品を手の届かないものにしている？もちろんそれもあるが、それは半分でしかないとMatt Ridleyは書く。”⇒

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posted at 00:06:36