黒木玄 Gen Kuroki
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- Web https://genkuroki.github.io/documents/
- 自己紹介 私については https://twilog.org/genkuroki と https://genkuroki.github.io と https://github.com/genkuroki と https://github.com/genkuroki/public を見て下さい。
2020年02月04日(火)
#統計 私はすでにP値がx以下になる確率をyとするプロットをかなり徹底的に行った経験があるのですが、本当はpowerのプロットを面倒がらずにもっとやるべきだったと思っています。 twitter.com/genkuroki/stat...
タグ： 統計
posted at 00:01:46
#統計
2×2の分割表の独立性検定について、powerのプロットを徹底的にやってくれる人が出て来るとよいと私は思っています。 twitter.com/genkuroki/stat...
タグ： 統計
posted at 00:04:09
#統計 2×2の分割表のχ²検定のYates補正は、χ²検定のP値を「片側確率の2倍」版のFisher検定に近付ける補正になっています。通常使われているFisher検定は「サンプル以下の確率の和」(minimum likelihood)版です。 twitter.com/koichi_5963/st...
タグ： 統計
posted at 00:07:27
#統計 Yatesさんの1984年の論文の内容はひどいので、2×2の分割表の独立性検定について考えたい人は反面教師として必見だと思う。 twitter.com/genkuroki/stat...
タグ： 統計
posted at 00:12:12
非公開
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posted at xx:xx:xx
引用:手術した患者のうち、甲状腺の一部を摘出した人の７％、全症例の６％でがんが再発し、再手術したことも明らかにしました。
再発の多さも早期発見の害。全摘が必要な症例には早期発見が無効で、早く見つけ過ぎたために縮小手術をやってしまい結局再発を増やしているのではないか
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posted at 00:45:16
#Julia言語 以下のリンク先のリンク先のコードとプロットは
nbviewer.jupyter.org/gist/terasakis...
でも閲覧できる。添付動画はそこにあったGIFアニメ。 twitter.com/mathsorcerer/s... pic.twitter.com/MjmgXR5TpM
タグ： Julia言語
posted at 00:45:57
#統計 せっかくなので、「サイコロA,B,Cのどれかである」という確率モデルでベイズ推定して、大外しの結果にベイズ更新が収束している場合の動画をこちらにも貼り付けておきます。
#Julia言語
nbviewer.jupyter.org/gist/genkuroki... pic.twitter.com/rwJT6AVldE
posted at 00:53:15
Today I learnt that this shape is not called 'weird lego piece' but in fact, a prismoid pic.twitter.com/ssGETdKQd6
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posted at 00:57:25
Star Wars' General Grievous cosplay by Wicked Armor. #StarWars #Cosplay #Costume #CraftYourFandom pic.twitter.com/ONfknP5dcu
タグ： Cosplay Costume CraftYourFandom StarWars
posted at 01:00:00
#統計 資料
【ベイズの法則では、信念が尺度になる】www
20世紀での統計学における論争の多くは双方に問題のある黒歴史扱いが妥当だと思う。それを面白おかしく特別な価値があるかのごとく宣伝するのはまずい。
数学的技術が未発展な段階で偉い人達がおかしなことを言っていた時代扱いが妥当。 twitter.com/todesking/stat... pic.twitter.com/CkI7hxQMWN
タグ： 統計
posted at 01:01:57
#JuliaLang solves this two language problem, @elonmusk. No need to convert Python to C++, deploy what you develop to production! twitter.com/elonmusk/statu...
タグ： JuliaLang
posted at 01:02:14
#統計 「新たな情報が入るたびに信念がベイズ更新されて行くのだ！」的なことを擬似哲学的にどんなに力を入れて語っていても、ベイズ更新時に使用される確率モデルの妥当性の問題に触れずに済ませるようだと、単に馬鹿にされて終わるだけになってしまうだろう。
ベイズ統計の周辺の数学は易しくない。 twitter.com/genkuroki/stat...
タグ： 統計
posted at 01:06:31
Sorry this ends the discussion. It's set in stone now pic.twitter.com/4EtqsEILCl
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posted at 01:22:03
ごまふあざらし(GomahuAzaras @MathSorcerer
めっちゃ面白い。
目からアザラシなことがいっぱいあってよい。
(後日気になった部分、Issueに投げます) twitter.com/kdwkshh/status...
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posted at 01:26:37
@keisei_otsuka 本質的に1行でお終い。ただし #Julia言語
using Combinatorics
[k for k in permutations(1:9)
if ((a, b, c) = (10k[2]+k[3], 10k[5]+k[6], 10k[8]+k[9]);
k[1] < k[4] < k[7] && k[1]*b*c + k[4]*a*c + k[7]*a*b == a*b*c)]
nbviewer.jupyter.org/gist/genkuroki... pic.twitter.com/Sn4gYR90ux
タグ： Julia言語
posted at 02:02:02
«We shall not cease from exploration, and the end of all our exploring will be to arrive where we started and know the place for the first time» - T. S. Eliot [Mandelbrot set zoom, magnification 1 .. 3.18 × 10³¹ buff.ly/2VJ9be7] #MotivationMonday #MathMonday pic.twitter.com/kOxAnu1pXL
タグ： MathMonday MotivationMonday
posted at 02:13:32
非公開
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posted at xx:xx:xx
胸が詰まりそうになりながら読んだ。
治療のために仕事を休めば収入に直結する、低賃金で国保料を払えず保険証がない等の理由でギリギリまで我慢し、手遅れ状態で病院にやってくる人を何人も見てきた
非正規社員、独り身のがん闘病 貯金や有休使い果たす：朝日新聞デジタル www.asahi.com/articles/ASN23...
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posted at 08:56:38
@pkuhar @elonmusk I know that is always my problem when advocating #JuliaLang. Seems to good to be true 😉 If go to ACCU 2020 I will actually have a talk specifically about how it is possible to make a Julia run so fast. flame.firebird.systems/archer-yates/A...
タグ： JuliaLang
posted at 09:17:38
ピエール瀧さんの復帰に対して「芸能界は甘い」という意見があるが、これは全く逆。仕事のない人の再犯率は3倍にも上り、法務省は助成金まで出して社会復帰に躍起になっている。実際、一般人は復帰させてくれる企業も沢山あったのに、芸能界の「見せしめ」が横行してきて、この流れを阻害し始めた。
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posted at 10:09:08
@genkuroki コメントありがとうございます…！連続補正の点は私も不勉強でした(自由度についても、ゆっくり読ませていただきます)
Julia、一時期触ってたのでコードも読ませていただきますね！勉強になります🙇♂️
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posted at 10:52:10
ただ、ドメイン知識はさておき、ベースとして統計学(頻度論からベイズまで)から機械学習~深層学習まで網羅的にアルゴリズムが使えないとこの領域は解析できない。加えて対スパコン対策。これはなかなか道のりがきびしい。。
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posted at 12:10:05
従来のゲノム医学では割と牧歌的なモデルを使っていた（そのせいで狭義の遺伝率に関わる分野しかわからないという制約があった）ところ、ブレイクスルーがあって一気に色々解析できるようになったけれど、ときすでにおすし🍣
タグ：
posted at 12:12:48
どこかで必ずゲノムコホート研究のリスクモデル解析の結果が実臨床へ実装のフェーズにうつるので、そこをブリッジできる人材はいまのところあまりいなそうでした。全領域において手薄とも言えるけど。。
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posted at 12:17:50
#統計 #Julia言語
おお！ここにもJulia使いが！
twitter.com/koichi_5963/st...
posted at 12:31:42
#統計 関連
例の連続性補正の Yates さんの1984年の論文はかなり困った内容なのに、その困った内容の論文を肯定的に引用するということが起こっている。
twitter.com/genkuroki/stat...
タグ： 統計
posted at 12:35:07
#統計 2×2の分割表の Fisher's exact test は原理的に不正確な検定なので、「正確な検定」だと習って信じた人達は騙されているのですが、どのように原理的に不正確であるかは、以下のリンク先の動画を含むスレッドの前後を見れば分かる。
twitter.com/genkuroki/stat...
タグ： 統計
posted at 12:37:13
#統計 名目有意水準xのもとで第一種の過誤が起こる確率yのかなり徹底的なプロットについては以下のリンク先のスレッドを参照。
本当はさらにpowerのプロットをもっと徹底的にやるべき。
第一種の過誤の確率だけではなく、powerのプロットもしておくことは非常に大事。
twitter.com/genkuroki/stat...
タグ： 統計
posted at 12:40:01
ずいぶん前から立ち行かなくなってる大学がどうやって民業圧迫するんですかね。予算が豊富でリソースが集まりまくり業績でまくりなら民業圧迫も可能でしょうが，ほとんど窒息寸前の大学を前にしてすら出てこない民間研究機関なんてただの幻想でしょうよ。 twitter.com/yukinoshibari/...
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posted at 14:15:39
Share News Japan @sharenewsjapan1
神戸大教授「毎年3千人亡くなる子宮頸がん対策をほったらかして国内死者ゼロのウイルス感染にパニクるのは合理的ではない」
snjpn.net/archives/178848
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posted at 14:37:54
岩永直子 Naoko Iwanaga『言 @nonbeepanda
9価ワクチンなら3回で10万円超えです。現状、日本で承認されている2価、4価ワクチンでしたら、約5万円です。それでも自費では高いので、小学校6年から高校1年生の女子は、公費接種のうちにぜひ。 twitter.com/hhkmasit/statu...
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posted at 14:43:57
New preprint: Alexis Arnaudon, Frank van der Meulen, Moritz Schauer, Stefan Sommer: Diffusion bridges for stochastic Hamiltonian systems with applications to shape analysis. arxiv.org/abs/2002.00885 #Julialang package: github.com/mschauer/Bridg... @arnaudon pic.twitter.com/aa3P694O5m
タグ： Julialang
posted at 15:34:58
例年インフルエンザでもノロでもこんな配慮はしないから不公平だし，マークシート試験だけで合否決めるのはけしからんと大騒ぎしたのは一体何だったのか。
headlines.yahoo.co.jp/hl?a=20200203-...
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posted at 15:35:30
猫のオフトゥンを購入して約4年、正しい使い方をしてくれる時がついにやってきた…！😭😭😭
#フェリシモ #猫部 pic.twitter.com/cyXhvAmTf1
posted at 15:44:54
定期接種は予防接種法で保護されている権利なのに、ワクチンの選択肢も知らされない・公費期限も教えてもらえない「騒動の被害者」がたくさんいます。皆で救いましょう。
「私たちを見殺しにしないで」 HPVワクチンをうつチャンスを逃した大学生が訴える2つの困りごと www.buzzfeed.com/jp/naokoiwanag...
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posted at 15:49:28
ということで、Pruittの件、日記の方にも記事を書いておいた。
不正なデータは世界を駆ける - 海の底には何がある kensuke-nakata.hatenablog.com/entry/20200203...
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posted at 16:38:19
「教員は熟読してくれ」小学校の漢字テストの微妙な部分の採点が厳しすぎる問題、実は文化庁がかなり柔軟に考えていた - Togetter togetter.com/li/1464234 @togetter_jpさんから
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posted at 16:52:53
Looking forward to having both a talk and a workshop on #JuliaLang at the #ACCUConf in Bristol, UK this March 24th! If you can't make it check out our @sixty_north Julia training sixty-north.com/julia_for_prog....
posted at 18:30:57
@sixty_north My motivation is to show people how fun and productive #JuliaLang programming is. It is not just for academics. I began programming to make games, so the fun factor has always been something I value. If you learn important lessons from fun or silly code, that is all that matters.
タグ： JuliaLang
posted at 18:44:13
Robert Geller; ロバート・ @rjgeller
8年前に某東大教員はM7首都直下地震が「4年内に70%の可能性」 と予言した。読売新聞とNHKが大々的垂れ流して、各メディアがフォロー。8年後、幸い首都直下起きていない。でも、某教員が予言しなかった熊本が16年に発生した。誰も責任取っていない、謝罪していない。 www.nikkei.com/article/DGXNAS...
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posted at 19:14:32
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posted at xx:xx:xx
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Alex V. Mantzaris @avmantzaris
@_cormullion Did you use gephi to produce these? Or some other package?
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posted at 19:36:34
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posted at xx:xx:xx
続き
「⇔」記号でざらざら式を繋げる人が分かっていない場合が多いという経験則について説明したが、「⇒」記号についても注意した方がよい。
「Aが成立する. ゆえにBも成立する」と「A ⇒ B」の意味が違うことを理解できない人は証明中で「⇒」記号を使うべきではない。
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posted at 19:44:52
まずクモの研究者には間違いなく影響出ますよね。
twitter.com/cyclosa_sp/sta... twitter.com/cyclosa_sp/sta...
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posted at 19:45:13
Alex V. Mantzaris @avmantzaris
@_cormullion Do you have the code on a github repo? It would be appreciated! :)
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posted at 19:54:21
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posted at xx:xx:xx
Alex V. Mantzaris @avmantzaris
@_cormullion Let us know if it goes up. Would be great (and apprrciated) to see how produce more graphs like this using Julia !
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posted at 20:17:40
子供授からないって最初からわかっていたら、あんな生理痛絶対我慢せず、さっさと子宮なんか取ってしまいたかった。
「いつかお母さんになるための大切な準備」とかいう言葉にどれだけ誤魔化されたか。
日本でピルが使えなかった我々世代は我慢するしかなかったし、その結果病気で産めなくなるなんて。
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posted at 20:24:38
件の人に勝手に謝辞に名前が載せられていた方のブログ記事。twitter.com/lambtani____/s... twitter.com/lambtani____/s...
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posted at 20:51:22
申請するだけで、お金が受け取れる制度があるって知ってるかな。赤ちゃんが生まれれば1人につき42万円。退職した際は、6000円程を90日〜150日分支給される。看護師だと受け取れるお金とかもあるのでDMくれたらお話しします。貰えるものは貰っとこ。 pic.twitter.com/AK6cs3TE9I
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posted at 20:54:48
「過剰診断・治療にならないよう注意しつつ…」「大規模で精密な超音波検査を行ったため」この２つを胸を張っていってしまえるのはすごい。（褒めてません！）もっとも、全て甲状腺がんが前倒し発見だとしても、若年層の甲状腺がんはほぼ寛解するからデメリットは大きい。headlines.yahoo.co.jp/hl?a=20200204-...
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posted at 21:34:08
@genkuroki @OokuboTact 小島寛之さんは結構売れた？統計学の本のイメージで、あれが合わなかったので興味なかったのですが、野矢茂樹さんも良くない感じなのですね……
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posted at 21:36:42
@monogusa802 @apj 【根拠やデータ】が大事なら、【教科書には順序と共に理解させる旨が書かれてある】というウソとか、学習指導要領にそのように書いてあるがごとくのデマを語ることはやめた方がよいでしょう。
掛算順序固定強制指導を擁護する人達の多くが平気でウソをつく点を私は繰り返し指摘しています。 #超算数
タグ： 超算数
posted at 21:42:22
@monogusa802 @apj #超算数 1周が360度であることは単なる慣習の一つに過ぎず、絶対的に従わなければいけないルールではありません。実際、弧度法では1周は2πです。
必然性がない単なる慣習は純粋数学的には不要ですが、他人とのコミュニケーションのためには暗記しておくことが必要になります。
続く twitter.com/monogusa802/st... pic.twitter.com/afLjqi7dMU
タグ： 超算数
posted at 21:50:16
@monogusa802 @apj #超算数 一方、掛け算の交換法則や小2の算数の教科書にある1つ分の数と幾つ分の数の立場を自由に入れ替えられるということは、自然に導かれてしまうことであり、「掛算は×記号で表す」とか「1周が360度である」というような従う必要がない単なる慣習とは全然違います。続く
タグ： 超算数
posted at 21:54:06
@monogusa802 @apj #超算数 しかも、掛け算を習った小2の次の学年である小3の段階の児童は、掛け算順序に拘らずに正しく考えて正解を出すかなり強い傾向を持っていることが分かっています。例えば以下のリンク先で紹介した小学校の先生による調査結果を見てください。続く
twitter.com/genkuroki/stat...
タグ： 超算数
posted at 21:58:05
@monogusa802 @apj #超算数 ところが、掛け算順序指導は生身の児童にとって意味がなさそうであることを強く示唆する調査結果を得た先生の結論は、掛け算順序指導を強化するべきだとするものでした。
私はそのような判断は子供の傾向を蔑ろにしており、非難に値すると思っています。続く
タグ： 超算数
posted at 22:00:53
@monogusa802 @apj #超算数 私は必要な情報を掛け算順序指導に批判的な小学校の先生が発信している情報からも得ており、そのような情報を発信している先生を尊敬しています。
ところがそういう先生であっても周囲の圧力で掛け算順序でバツを付けさせられているケースもあるようで、ひどい話だと思っています。続く
タグ： 超算数
posted at 22:03:57
#RTで私を有名にしてください
便乗してみます🙇♂️
長さ 6mm 革製 手染め手縫いのブーツです。
メイキングです😊 pic.twitter.com/6KDk3adLeT
タグ： RTで私を有名にしてください
posted at 22:05:25
@monogusa802 @apj #超算数 この掛け算順序固定強制指導問題の第一の被害者は子供達なのですが、まっとうな常識的な意見を持っている先生達も被害者になっていると思います。
結構深刻な問題。
それなのにデマを平気で飛ばすクズのような大人達が繰り返し湧いて出て来る。
クズはクズであることを自覚するべき。
タグ： 超算数
posted at 22:07:17
Dr Shoko Sugasawa 菅澤 @ShokoSugasawa
話題になっているJonathan Pruitt氏のデータ不審疑惑について。誤解を招きそうなつぶやきも見かけたので、私なりの理解をリンク付きでつぶやきます。Links & comments re. #pruittdata #PruittGate #SpiderGate for Japanese tweeters. 1/6
タグ： pruittdata PruittGate SpiderGate
posted at 22:15:04
Dr Shoko Sugasawa 菅澤 @ShokoSugasawa
最初に撤回された２つの論文の筆頭著者であるKate Laskowski氏のブログ。撤回された研究のアイディアを思いついたのは彼女ですがデータを集めたのはPruitt氏です。事の発端や彼女がどう意思決定し、行動したかを誠実に丁寧にまとめてあります。2/6 laskowskilab.faculty.ucdavis.edu/2020/01/29/ret...
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posted at 22:15:05
Dr Shoko Sugasawa 菅澤 @ShokoSugasawa
一番最初に撤回された論文の出版元であるAmerican Naturalistで、Editor in ChiefとしてLaskowski氏と連携して撤回手続きを行ったDaniel Bolnick氏のブログ記事。一番目の記事では事態の現状が簡潔にまとまっています。3/6 ecoevoevoeco.blogspot.com/2020/01/the-pr...
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posted at 22:15:05
Dr Shoko Sugasawa 菅澤 @ShokoSugasawa
二番目の記事では、Bolnick氏個人の目から見た一連の出来事が時系列に沿って解説されています。4/6 ecoevoevoeco.blogspot.com/2020/01/the-pr...
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posted at 22:15:05
Dr Shoko Sugasawa 菅澤 @ShokoSugasawa
Pruitt氏が関わった過去の論文のうち、撤回・調査中・データの信用性が確認されたものなどのリスト。Bolnick氏がまとめてくださったもので、調べられている論文の数は増えているようです。これまでに引用した論文の信用性などが気になる方は確認してみてください。5/6 docs.google.com/spreadsheets/d...
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posted at 22:15:06
Dr Shoko Sugasawa 菅澤 @ShokoSugasawa
最初のつぶやきにあるハッシュタグで検索するともっと出てきます。一連の事態で私の身の回りでも影響を受けている人がいます。とくに彼の共著者の若手のキャリアに与える影響は計り知れないように思えます。6/6
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posted at 22:15:06
@monogusa802 @apj #超算数 まあ、そう悪意に取らずに、事実関係の確認をすませましょうよ。
【読めと言われたものを読んだらそう書いてあっただけ】
とのことですが、どこに何が書いてあったのでしょうか？
【教科書には順序と共に理解させる旨が書かれてある】と書いてあったのでしょうか？ twitter.com/monogusa802/st... pic.twitter.com/DIMrOn6zDQ
タグ： 超算数
posted at 22:23:07
きっちりまとめてくださっていました。twitter.com/shokosugasawa/... twitter.com/shokosugasawa/...
タグ：
posted at 22:37:16
21世紀初頭、人類は、型推論もなく数値計算にも適さないpythonという前世紀の言語を人工知能ブームの際の標準言語として採用し、apiや環境構築をあえて分かりにくくすることによって、多大な雇用を創出することを試みた。そして、それは事実成功したのである。その時代はJuliaの使用が禁止されていた。
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posted at 22:47:17
鈴木眞一さんは明らかに間違えていて、(少なくとも今は)切る必要がない甲状腺を既にたくさん切ってるんですよ。酷い話です。鈴木さんが本当にそれを理解していないなら極めて愚かですし、理解してるなら極めて悪質です。どちらにしても、擁護する余地は全くありませんね twitter.com/hseino1/status...
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posted at 23:16:48
安東さんはどうしてこのニュースを論評なしにツイートされたのでしょうか。検査継続に賛成していると思われますよ twitter.com/ando_ryoko/sta...
タグ：
posted at 23:25:26
Googleで #Julia言語 について検索したい人は
www.google.com/preferences
検索の設定
で地域の設定を「アメリカ合衆国」にして、保存ボタンを押し、
www.google.com/search?q=julia
julia を検索
するとよいです。プログラミング関連の検索が多いならJuliaと無関係にこうしておいてもいいかも。
タグ： Julia言語
posted at 23:34:21
