黒木玄 Gen Kuroki
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2022年11月02日(水)
Medscape「COVID-19へのイベルメクチン：棺桶の最後の釘」 www.medscape.com/viewarticle/98... 効果があるとした臨床試験は不正と判明、それ以外の臨床試験では偽薬と比較して優位を示せず、米国の臨床試験ではないからという言い訳も米国のACVTIVE-6試験が同様であったことで潰えたと。
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posted at 00:02:33
Togetter（トゥギャッター） @togetter_jp
「効率を突き詰めた結果、ものすごい力技になってしまった物流現場の風景「トラックダンパーって設備」」togetter.com/li/1966328
に大注目！あなただけには読んでほしいよぅ。 作成者:@nekome006
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posted at 01:10:07
Ali AlSaibie | علي ا @AliAlSaibie
The state of #JuliaLang is strong.
And I believe it to now be ready for adoption in engineering curriculum, bypassing the move to Python, if coming from MATLAB.
youtu.be/N4h46_TCmGc
タグ： JuliaLang
posted at 01:52:30
格子タンパク質モデルという謎モデルに遭遇して困惑している人もいるようですが、もちろんそのモデルには理由も目的もあります。もともとは高分子の格子モデルがあり、それをタンパク質に応用したものです。
現実のタンパク質を再現することを目指すのではなく、タンパク質共通の性質を知りたい。
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posted at 10:31:40
たとえば折れたたみ現象の普遍的な原理を知りたい。
郷信広先生が70年代に提唱された「整合性原理」はまさに格子タンパク質(それも二次元)の統計力学から生まれたものです。タンパク質のエネルギー構造が漏斗型であるという「ファネル描像」もChanとDillが小さな格子モデルの計算で提唱しました。
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posted at 10:35:07
使い道はあるんですよ。たとえば、僕の学生だった剣崎さんは、リゾチーム・ファミリーが示す多彩な折れたたみ過程の起源をひとつだけ調整パラメーターを含む格子タンパク質モデルで説明しました
www.sciencedirect.com/science/articl...
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posted at 11:03:30
修士学生だった中西君はふたつのタンパク質が複合体形成するときの空間サイズ効果を格子タンパク質モデルで明らかにしました。この研究は半端におわっていて、もうちょっと網羅的にやればよかったのですが、エッセンシャルなところは書けたかなと思います
www.jstage.jst.go.jp/article/jpsj/7...
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posted at 11:07:57
別に僕たちの使い道がベストだと言いたいわけではないけど、要は現実離れした格子タンパク質モデルには格子モデルなりの使い道があるということです。
現実のタンパク質の構造を精度よく再現することだけが研究ではありませんから。
何かが説明できたり、新しい原理が提唱できればよい
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posted at 11:10:38
みんながみんな全原子分子動力学を使って現実にあるタンパク質を再現する計算をしなくちゃならないわけではありませんから。
むしろ「何を示したいか」がだいじで、モデルはそれに合わせて適切なものを選べばよい。
格子タンパク質モデルは現実離れしてるけど、それで言えることもあるわけ
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posted at 11:12:59
日経バイオテク＠無料メルマガ配信中 @nikkeibiotech
塩野義製薬は、COVID-19に対する治療薬やワクチンなどへの投資に注力したため、研究開発費は過去最大の487億円となりました。第2/3相で成功したゾコーバは国内では審査の継続中で、手代木社長によれば「中国では来年のなるべく早い時期の実用化を目指す」とのことですbio.nikkeibp.co.jp/atcl/news/p1/2...
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posted at 12:48:49
@G5CaG2Unj36b8S9 @genkuroki なお、現在行われているphase 3 のusでの治験登録では
Primary Outcome Measures :
1Median Time to Sustained Symptom Resolution
と明記しています。
clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT05... pic.twitter.com/CpigWU41KP
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posted at 13:10:20
#統計
その情報は見てなかったので助かります。
TNさん、どうもありがとうございました。
この話題の文脈確認：信頼区間が0をまたいでいるので、primary outcome measureにされている症状消失までの時間の中央値についてプラセボとの比較で有意差が出ていない。
www.shionogi.com/content/dam/sh... twitter.com/tomoak1n/statu... pic.twitter.com/XKuN5CWMIp
タグ： 統計
posted at 13:34:19
@genkuroki 一応、このusでのtrial登録は次のglobal phase 3の話で、今解析を報告しようとしているやつ(第2/3相臨床試験 Phase 3 part)とは別なので、評価が完全に同じである必然性はないことに注意してくださいね(書き方)。本質は、同じ評価をするべきだろうですが。 pic.twitter.com/khV4ie3Z3o
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posted at 13:43:58
結局これなんですよね。
「学問的な正しさより自分たちの作ったルールを守れるかどうかを優先する。」
大人になっても、科学の法則や法律より、自分たち(または学校、偉い人)が決めたルールが優先されると勘違いしている教員や保護者も少なくないように思います。 twitter.com/3h1m4/status/1...
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posted at 13:58:49
［注目記事］【塩野義製薬】期初予想の業績変更せず‐手代木社長、「ゾコーバ」売上高見込む｜薬事日報ウェブサイト www.yakuji.co.jp/entry99447.html pic.twitter.com/HMAmNHwZus
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posted at 14:24:44
#統計 この注意もサンキュ！
global phase 3 では症状消失までの時間の中央値について有意差が出てくれれば良いとは思うのですが、現時点ではそうならない可能性も結構あるようにも見える。
global phase 3での標本サイズの見積もりはどうなっているんだろうか？ twitter.com/tomoak1n/statu...
タグ： 統計
posted at 14:32:24
#統計 ゾコーバ
5症状消失までの時間の中央値のプラセボ群との差の信頼区間が
125 mg → [-78.7, 11.7]
250 mg → [-73.8, 7.2]
で0を含んでいるのに「有意に短縮」と書いてあるのを見て、この手の話題では、そもそも「有意」と書いてあっても信用できないことを学んだ。
www.shionogi.com/content/dam/sh... twitter.com/genkuroki/stat... pic.twitter.com/bkfOfmWNXG
タグ： 統計
posted at 14:46:34
#統計 ゾコーバ
しかもその「信用できない」の意味は、「統計的に有意なだけで信用してはいけない」というよく言われているスタンダードな意味ではなく、
「有意」と書いてあっても本当は全然有意でないかもしれない
という意味になります。
これには参った。
www.shionogi.com/content/dam/sh... pic.twitter.com/G67qkpCYuY
タグ： 統計
posted at 14:46:37
塩野義のコロナ飲み薬「ゾコーバ」、22日にも公開で承認審議 ７月以来再びwww.asahi.com/articles/ASQC2...
ゾコーバはウイルスの増殖を妨げる働きがあり、軽症や中等症の患者が対象として想定されている。
政府は薬事承認されれば速やかに100万人分を購入することで塩野義と基本合意している。
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posted at 14:56:31
#統計 結果的に5症状消失までの時間の中央値について対プラセボで有意差を出せなかったPhase 3のための必要な標本サイズの事前見積もりについては以下のリンク先を参照。 twitter.com/genkuroki/stat...
タグ： 統計
posted at 15:06:32
#統計 十分な検出力を確保するための事前の標本サイズの見積もり時に使った仮定は、Phase 2bの結果を元にした5症状消失までの時間の中央値は
ゾコーバ125mg→8.3日
プラセボ→11.1日
という予想で、しかも、中央値の差の検定ではない別の検定の検出力を基準に必要な標本サイズを見積もっている。続く twitter.com/genkuroki/stat...
タグ： 統計
posted at 15:21:34
#統計 データ中の都合の良い部分から得た予想は信用できないことが多く、少なくとも、ひどく楽観的になるリスクを意識しておく必要があります。
そして、薬の効果を中央値で測るならば、中央値の差に関する検定の検出力を上げる必要があるのですが、全然違う検定の検出力を基準に使ってしまった。 twitter.com/genkuroki/stat...
タグ： 統計
posted at 15:21:35
こういう💩教育を肯定的に広めようとする【個人】に対して、それは違うよと言い続けるのは必要だと思いますね。
別にこの人に伝わらなくてもいい、少なくともそれを見て正しい理解に辿り着く保護者や子供達はいるので。 twitter.com/3h1m4/status/1...
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posted at 15:39:24
#統計 ゾコーバに関する「統計的に有意」と書かれた9/28のプレスリリース www.shionogi.com/jp/ja/news/202... (添付画像①)は、株価のに影響を与えていると思います(② minkabu.jp/stock/4507/chart)。
しかし、10/12の www.shionogi.com/content/dam/sh... には有意差がないことを意味する信頼区間が書かれていた！(③) pic.twitter.com/s295DxNW8P
タグ： 統計
posted at 15:53:35
研究不正を告発する側のCOI開示も重要と。無罪でも訴えられただけで相当な労力を奪われるので、そらそうよという感じか。 twitter.com/microbiomdiges...
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posted at 16:10:01
関連 www.asahi.com/articles/ASQC2...
【政府は薬事承認されれば速やかに100万人分を購入することで塩野義と基本合意している】 twitter.com/asahi_gyousei/...
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posted at 16:25:36
#統計 プレスリリースやニュース記事に「統計的に有意」と書いてあっても、有意差があって欲しい効果の指標の差に関する検定ではない別の検定のP値が5%未満なだけで、実際には効果の指標に関する肝腎も結果は統計的に有意でない可能性まで考慮に入れなければいけない地獄が発生しているという問題。 twitter.com/genkuroki/stat...
タグ： 統計
posted at 17:26:00
#超算数 【授業で習っていないものを使ったら✕】を支持する方々に考えてもらいたいです。特定の知識や方法を知るときに、その来源まで覚えているようにと子供に要求するのは正当でしょうか。例えば、文章に初出する単語全てに注をつけるなんて、論文でもしませんよ。 twitter.com/3H1M4/status/1...
タグ： 超算数
posted at 18:14:01
出たっ、算数の掛け算の順序を問う問題！！
「6×4」だって「4×6」だって同じじゃねえか！！
これで不正解にするなんて、どうかしてるぞ！！！！
……息子…「イ」はどう考えても違うんじゃない…？ pic.twitter.com/4sDL7NdlrY
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posted at 19:34:19
塩野義製薬が開発中の新型コロナの飲み薬「ゾコーバ（一般名・エンシトレルビル）」について、厚労省は22日にも専門家による部会を開いて承認の可否を審議する方針を固めました。「緊急承認制度」を使う見込みで、公開の会議で議論します。
www.asahi.com/articles/ASQC2...
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posted at 20:00:03
@breathingpower 「水からの伝言」を発見
ホーム - 稚内市立増幌小中学校
2021年12月27日
masuhoro.edumap.jp/blogs/blog_ent...
＞最後の校長あいさつでは、「水からの伝言」という本のお話をもとに、水も人間も優しい言葉をかけることの意味についてお話ししました。
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posted at 20:15:22
#統計 色々情報を見た後だと、このイベントはめちゃくちゃ楽しみな感じ。
「5症状消失までの時間の中央値の差の信頼区間が0を含むので、有意差は出なかった」と認定すれば、他にも影響が及ぶので非常に面白いことになる。
その辺を誤魔化すなら、私は個人的に関係者集団を信用するのをやめるかも。 twitter.com/asahi_apital/s...
タグ： 統計
posted at 20:53:15
中村 龍矢 | LayerX 執行役員・ @nrryuya_jp
東工大の渡辺澄夫先生の統計学入門スライドにて、よくある「頻度主義とベイズ主義のどちらが正しいか」の話に、極めて明快な回答が。
watanabe-www.math.dis.titech.ac.jp/users/swatanab... pic.twitter.com/IjUbhbcrSV
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posted at 21:00:01
中村 龍矢 | LayerX 執行役員・ @nrryuya_jp
主義を争う悲しみの歴史から、手段はなんでもいいので、単純に未知の分布との誤差を数学的に推定して、小さいものを使おう、という自然な統計に。 pic.twitter.com/HeZZVZ8YP2
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posted at 21:03:10
ごまふあざらし(GomahuAzaras @MathSorcerer
#Julia言語 楽しいけれどアザラシディスタンス内(=所属組織内)にてガンガン議論できる人がいなくて人生辛いってなってる．
タグ： Julia言語
posted at 21:20:13
インフルエンザ流行期に38度の熱と咳嗽があれば、79%の確率でインフルエンザと言う疫学調査の報告があります。
これを検査前確率として検査前オッズに変換すると、3.76です。
検査陽性の場合、陽性尤度比LR+は34.6です。これを検査前オッズに掛けると130.1、確率に変換すると、
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posted at 21:27:04
検査後確率は99.2%となります。すなわち、99%インフルエンザと解釈されます。
一方、検査陰性の場合の検査後オッズは、陰性尤度比LR-の0.384を検査前オッズに掛けると1.44、確率に変換すると、この時の検査後確率59%です。
つまり、迅速検査が陰性でも、インフルエンザである確率が実に59%もある
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posted at 21:27:41
#統計 渡辺澄夫さんの解説スライドは味があって面白いですよね。そして大事なことがシンプルに書いてある。
「小さな世界」の前提が必要だという最重要事項の説明がされていない場合がある問題については以下を参照。
↓
watanabe-www.math.dis.titech.ac.jp/users/swatanab... twitter.com/nrryuya_jp/sta... pic.twitter.com/OgSno2k7IS
タグ： 統計
posted at 21:27:50
ので、たとえインフルエンザと診断されなくても、マスク・手洗・うがいなど、周囲への感染対策を怠らない事が必要です。
医師によっては再度受診となってしまう負担を考えて、事前確率が十分高ければ検査しないでタミフル等のノイラミニダーゼ阻害薬を処方される事もあるでしょう。
検査が単純な
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posted at 21:28:33
#統計
私のツイログで「小さな世界」を検索
↓
twilog.org/genkuroki/sear...
小さな世界と大きな世界については Statistical Rethinking にも書いてあり、その部分は無料で読めます。
xcelab.net/rmpubs/sr2/sta... pic.twitter.com/PFZT3j5Dco
タグ： 統計
posted at 21:30:39
ごまふあざらし(GomahuAzaras @MathSorcerer
#Julia言語
あ，こんなところに advent-calendar があるぞ！
(・ω・｀)！！！
qiita.com/advent-calenda...
タグ： Julia言語
posted at 21:38:36
#囲碁
youtu.be/pHQyI7Ack5c
【名人戦独占中継】井山裕太名人ー芝野虎丸九段、決着へ２日目【第47期囲碁名人戦第7局】
11/3(木)午前9時から始まります。
11/3(木)は祝日なので視聴できる人はたくさんいると思います。
タグ： 囲碁
posted at 21:55:48
#囲碁 以下のリンク先からKaTrainというソフトをダウンロードしてインストールすれば、それだけでKataGoで研究しながら観戦できる。
注意警告：この囲碁ソフトはクソ強いのでこれに挑戦するときにはフルボッコの覚悟が必要。情け容赦なくボコって来ます。
github.com/sanderland/kat...
タグ： 囲碁
posted at 22:05:38
@tomoak1n @G5CaG2Unj36b8S9 あれ？なんか私の話もしている？坂口さんはミュートしました。
私が、「差の信頼区間と統計的有意差の関係について説明をせよ」という試験問題に正解できない人には理解できない話をしているのは確かなことだと思います。
可能ならばこのやり取りでは返答先から私を外してください。
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posted at 22:11:50
#囲碁 KaTrainの良い点はこれを1つ入れるだけでよく、特別な設定が不要なことです。
「これ1つを入れるだけ」で「適当に負けてくれるモード」と「全力で殴ってくるモード」の両方が使えるソフトがあると良いと思います。
1つだけで全部まかなえると他人に勧め易くなる。
github.com/sanderland/kat...
タグ： 囲碁
posted at 22:21:19
@aa38052 @G5CaG2Unj36b8S9 海外治験は差の信頼区間が0を跨がない。日本治験は信頼区間は0をまたぐが同傾向。本来なら、メタ解析せよだけど、まず大丈夫では。国内治験だけで考えるとわからん。 twitter.com/tomoak1n/statu...
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posted at 23:31:59
三年B組一八先生(金八じゃないよ) @uKi2wQXyG7rx3gL
@eight_bridges @LimgTW @golgo_sardine はいはいマナー講師。
論理的に負けた超算数派の敗北宣言ですね
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posted at 23:33:30
@i_mugimugi_love @E_Fessenden @golgo_sardine @Mag_Netism また、学習指導要領に関しては、意味の理解は構わんが、順序は決めてなく、指導要領を根拠に掛け算の順序に意味がある解釈は「深く考えすぎ」とコメントしている。
上の例では「100円が5個」という意味を確認するのは良いが、「100×5 の順序でなければならない」は別に求めてない。 pic.twitter.com/ExMouuwDes
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posted at 23:51:50
